More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3519 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3519  dihydropyrimidinase  100 
 
 		 488 aa  1010    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4086  amidohydrolase  49.59 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  42.13 
 
 		 483 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  39.75 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  34.94 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.2 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  29.4 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  27.94 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  27.94 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  27.94 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  28.19 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  27.94 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  27.99 
 
 		 453 aa  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  28.85 
 
 		 458 aa  153  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  27.59 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  27.99 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  27.59 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1099  amidohydrolase  29.05 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  27.59 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  27.59 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  28.37 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  29.31 
 
 		 472 aa  147  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  27.72 
 
 		 457 aa  146  9e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  29.2 
 
 		 489 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  29.34 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  29.2 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.78 
 
 		 454 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  29.23 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  41.35 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  26.25 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  28.48 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  25.79 
 
 		 464 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  28.81 
 
 		 470 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  27.63 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  27.63 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  28.25 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  30.06 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  26.9 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  26.95 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  28.98 
 
 		 484 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  27.74 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  28.57 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  29.17 
 
 		 496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  29.38 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  25.35 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  29.63 
 
 		 444 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  29.75 
 
 		 477 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  26.98 
 
 		 468 aa  133  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  28.19 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  28.85 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  28.66 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.84 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  29.46 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  29.16 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  27.58 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  28.06 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  30.18 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0214  dihydropyrimidinase  26.05 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  28.86 
 
 		 479 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  30.21 
 
 		 485 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  27.18 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  28.85 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  27.86 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.94 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.46 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  28 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  29.98 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  28.63 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  29.42 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  28.25 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  29.28 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  27.53 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  29.41 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  28.07 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  28.34 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  28.42 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  28.16 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  28.6 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  27.62 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  27.81 
 
 		 501 aa  127  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  30.14 
 
 		 476 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  28.16 
 
 		 475 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  28.05 
 
 		 444 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  28.48 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  27.07 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  27.66 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  27.12 
 
 		 480 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  29.07 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  26.32 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  27.25 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  28.48 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  23.69 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  27.09 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  30.3 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  28.42 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  27.85 
 
 		 485 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  28.81 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  27.85 
 
 		 485 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  28.32 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  28.09 
 
 		 483 aa  123  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>