More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2544 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  100 
 
 
459 aa  940    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2641  amidohydrolase  62.36 
 
 
452 aa  580  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  62.22 
 
 
458 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  61.74 
 
 
459 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  61.97 
 
 
459 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3514  allantoinase  60.58 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3013  amidohydrolase  44.62 
 
 
461 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2181  putative allantoinase  44.18 
 
 
461 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2040  putative D-hydantoinase  44.18 
 
 
461 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417545  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.14 
 
 
454 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  36.24 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.82 
 
 
449 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  29.14 
 
 
452 aa  189  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.24 
 
 
432 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  32.04 
 
 
461 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  34.14 
 
 
468 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  38.18 
 
 
454 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  28.45 
 
 
451 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  30.8 
 
 
448 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  30.69 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  30.69 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  30.69 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  30.69 
 
 
461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  30.69 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  30.69 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  30.47 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  29.28 
 
 
460 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  30.47 
 
 
461 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  30.11 
 
 
489 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  30.11 
 
 
489 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.36 
 
 
457 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.04 
 
 
494 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  29.48 
 
 
483 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  30.06 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  31.19 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  31.77 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  26.02 
 
 
464 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  27.48 
 
 
464 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  30.46 
 
 
447 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  28.66 
 
 
484 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  30.26 
 
 
470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  26.97 
 
 
456 aa  156  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.31 
 
 
468 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  29.09 
 
 
485 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  29.69 
 
 
475 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  28.6 
 
 
475 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  30.34 
 
 
448 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  28.91 
 
 
484 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.71 
 
 
444 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  29.61 
 
 
484 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  28.87 
 
 
485 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  28.66 
 
 
484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  28.97 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  28.48 
 
 
485 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  29.35 
 
 
487 aa  154  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  27.39 
 
 
455 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  29.26 
 
 
449 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  33.11 
 
 
449 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  27.69 
 
 
449 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  25.93 
 
 
472 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  26.89 
 
 
489 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  26.54 
 
 
453 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  26.54 
 
 
453 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  26.54 
 
 
453 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  26.54 
 
 
453 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  29.82 
 
 
447 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  27.23 
 
 
457 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  29.91 
 
 
467 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  31.49 
 
 
440 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  30.13 
 
 
485 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  28.57 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  30.48 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  26.48 
 
 
460 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  28.6 
 
 
484 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  27.17 
 
 
453 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  26.96 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  28.51 
 
 
484 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  27.33 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.46 
 
 
418 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  26.74 
 
 
453 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  32.57 
 
 
443 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  26.74 
 
 
453 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  28.17 
 
 
475 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  30.84 
 
 
503 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  29.68 
 
 
446 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  27.11 
 
 
453 aa  145  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  27.99 
 
 
499 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  28.24 
 
 
462 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  29.44 
 
 
446 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  33.1 
 
 
457 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  28.17 
 
 
475 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  28.17 
 
 
475 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  24.52 
 
 
479 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  28.9 
 
 
455 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  25.27 
 
 
458 aa  144  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  28.91 
 
 
442 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.57 
 
 
442 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  29.77 
 
 
435 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  28.9 
 
 
485 aa  144  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  25.75 
 
 
418 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>