More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2181 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2181  putative allantoinase  100 
 
 
461 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3013  amidohydrolase  92.41 
 
 
461 aa  883    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2040  putative D-hydantoinase  100 
 
 
461 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417545  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  44.18 
 
 
459 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  43.33 
 
 
459 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  43.62 
 
 
459 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2641  amidohydrolase  44.32 
 
 
452 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3514  allantoinase  44.77 
 
 
460 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  42.89 
 
 
458 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.48 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  34 
 
 
454 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.08 
 
 
454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  29.8 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  32.65 
 
 
448 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  30.02 
 
 
461 aa  170  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  30.75 
 
 
483 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  32.05 
 
 
455 aa  159  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  34.39 
 
 
446 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  30.05 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  27.37 
 
 
449 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  28.15 
 
 
489 aa  153  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  28.15 
 
 
489 aa  153  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  32.1 
 
 
503 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  30.96 
 
 
475 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  32.87 
 
 
454 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  26.59 
 
 
451 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  27.49 
 
 
484 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  29.22 
 
 
460 aa  150  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  29.96 
 
 
475 aa  150  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.5 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.8 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  30.58 
 
 
444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  26.1 
 
 
460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  25.86 
 
 
448 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  30.5 
 
 
449 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  32.72 
 
 
476 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  31.07 
 
 
432 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  28.76 
 
 
469 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  30.87 
 
 
449 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  30.07 
 
 
469 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  30.65 
 
 
447 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  27.91 
 
 
472 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  28.7 
 
 
483 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  28.74 
 
 
501 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  28.93 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  31.36 
 
 
450 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  27.75 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  28.57 
 
 
483 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  27.52 
 
 
453 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  27.52 
 
 
453 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  27.75 
 
 
453 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  27.75 
 
 
453 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  26.96 
 
 
484 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  26.16 
 
 
464 aa  139  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  30.79 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  28.04 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  28.04 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  27.52 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  28.04 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  27.92 
 
 
484 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  27.41 
 
 
485 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  27.89 
 
 
489 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  26.44 
 
 
483 aa  136  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  25.92 
 
 
458 aa  136  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  27.93 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  27.93 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  27.29 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  27.93 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  27.93 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7944  amidohydrolase  30.91 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  27.93 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  27.93 
 
 
461 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  27.93 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  27.06 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  27.27 
 
 
487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  27.06 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  27.06 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  27.06 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  30.16 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  32.55 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  27.93 
 
 
461 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  27.84 
 
 
489 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  25.77 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  28.48 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  25.83 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.17 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  27.15 
 
 
484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  29.3 
 
 
475 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  27.45 
 
 
462 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  28.61 
 
 
445 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  33.18 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  26.14 
 
 
484 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  34.08 
 
 
569 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  24.94 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  28.35 
 
 
444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  28.94 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  26.08 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  26.64 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  24.83 
 
 
456 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  27.97 
 
 
444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>