More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6703 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  100 
 
 		 497 aa  1010    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  41.26 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  33.87 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  34.55 
 
 		 497 aa  243  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  29.65 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  25.15 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.5 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  22.99 
 
 		 528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  25.14 
 
 		 530 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.76 
 
 		 545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.83 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.47 
 
 		 491 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  26.58 
 
 		 533 aa  113  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 533 aa  113  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.38 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  27.12 
 
 		 558 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.69 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.1 
 
 		 478 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  24.95 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.81 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.48 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.39 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.44 
 
 		 478 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  26.35 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.25 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  25.55 
 
 		 485 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.18 
 
 		 491 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  24.82 
 
 		 528 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.15 
 
 		 486 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  23.81 
 
 		 557 aa  95.1  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  27.36 
 
 		 504 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.7 
 
 		 493 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.73 
 
 		 534 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  24.44 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  24.44 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  24.44 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  25.19 
 
 		 523 aa  90.5  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.85 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.85 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.29 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  25.94 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.26 
 
 		 651 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.55 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.55 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.4 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  26.06 
 
 		 507 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.52 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  24.85 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.49 
 
 		 546 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.7 
 
 		 475 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.7 
 
 		 475 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.7 
 
 		 475 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.7 
 
 		 475 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  21.58 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.7 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  24.95 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.14 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.39 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  24.76 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.33 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.33 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  26.55 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.6 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.9 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  23.52 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.61 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.12 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.25 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  22.56 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.64 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.19 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.9 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.24 
 
 		 516 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  22.81 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.08 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  23.88 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.9 
 
 		 495 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  27.54 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  21.89 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.82 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  24.72 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.57 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.56 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.98 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  52.38 
 
 		 578 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.62 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  47.78 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  29.53 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  47.73 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 560 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  27.65 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  45.56 
 
 		 575 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  56.45 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  54.84 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  25.54 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  45.56 
 
 		 573 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  22.8 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  26.33 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  27.55 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>