250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6214 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  100 
 
 
490 aa  967    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  41.26 
 
 
497 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  36.53 
 
 
481 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  36.18 
 
 
497 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  30.72 
 
 
493 aa  229  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1852  D-aminoacylase domain protein  26.01 
 
 
456 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000129758  normal  0.0198034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.57 
 
 
529 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3298  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.31 
 
 
548 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0263  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.67 
 
 
533 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1501  N-acyl-D-glutamate deacylase  25.49 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6759  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29 
 
 
516 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.82 
 
 
532 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  29 
 
 
533 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1358  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.14 
 
 
534 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.96 
 
 
477 aa  107  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0310888  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2958  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.61 
 
 
528 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3031  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.95 
 
 
525 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2753  Amidohydrolase 3  22.66 
 
 
530 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  25.97 
 
 
534 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5575  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.23 
 
 
534 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2691  amidohydrolase family protein  21.68 
 
 
523 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1552  N-acyl-D-glutamate deacylase  29.31 
 
 
507 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  26.45 
 
 
486 aa  94  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.81 
 
 
486 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2657  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.19 
 
 
493 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2790  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.19 
 
 
493 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  24.44 
 
 
1076 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.36 
 
 
494 aa  91.3  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.36 
 
 
531 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06353  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  22.95 
 
 
481 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0663  dihydroorotase  24.71 
 
 
493 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0559  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.41 
 
 
493 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2128  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.6 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2740  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.6 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  24.35 
 
 
485 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0641  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.45 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.388826 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0178  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  26.99 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2389  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  26.99 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2770  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  26.99 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2309  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  26.99 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.21 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2766  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.6 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  24.95 
 
 
848 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5481  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.52 
 
 
529 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6068  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.71 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.01 
 
 
511 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  21.65 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  24.75 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3978  N-acyl-D-glutamate deacylase  39.26 
 
 
534 aa  85.1  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.84 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4816  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.4 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0546  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  25.35 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4058  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.42 
 
 
493 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  25.1 
 
 
494 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0837  D-aminoacylase  25.46 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0674  N-acyl-D-aspartate deacylase  25.46 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0658  N-acyl-D-aspartate deacylase  25.46 
 
 
493 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.227387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0415  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.2 
 
 
491 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4439  N-acyl-D-amino-acid deacylase  26.82 
 
 
478 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.602072  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  24.9 
 
 
480 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.92 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.92 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1130  N-acyl-D-glutamate deacylase  27.99 
 
 
499 aa  80.1  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0978  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.56 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  27.04 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4959  N-acyl-D-amino-acid deacylase  27.03 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.555934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1467  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.86 
 
 
565 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1032  N-acyl-D-amino-acid deacylase  28.1 
 
 
545 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.396344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  24.51 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3947  N-acyl-D-glutamate deacylase  43.3 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.291331  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5490  N-acyl-D-amino-acid deacylase  47.75 
 
 
532 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250149  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4772  D-aminoacylase  26.09 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911342  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1221  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.51 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  27.92 
 
 
530 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5117  N-acyl-D-amino acid deacylase family protein  24.61 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2530  N-acyl-D-aspartate deacylase  26.23 
 
 
522 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.296499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0720  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.96 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.066305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0091  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.8 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.64957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2609  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.62 
 
 
651 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4020  N-acyl-D-amino-acid deacylase  24.31 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3331  N-acyl-D-amino-acid deacylase  23.33 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  25.89 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  41.96 
 
 
620 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0069  Amidohydrolase 3  39.29 
 
 
539 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.34 
 
 
478 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  40.52 
 
 
478 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.5 
 
 
478 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  28.52 
 
 
453 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  28.52 
 
 
453 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  28.52 
 
 
453 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.79 
 
 
491 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  28.52 
 
 
453 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.52 
 
 
453 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.52 
 
 
453 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1417  dihydroorotase  40.21 
 
 
558 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  28.52 
 
 
453 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00370  D-aminoacylase, putative  36.04 
 
 
557 aa  60.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  42.05 
 
 
431 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  34.48 
 
 
426 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>