201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2448 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 426 aa  860    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  75.76 
 
 		 425 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  41.01 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  40.31 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  39.27 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.94 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  34.02 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  33 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  32.54 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  31.6 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  34.91 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  36.42 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  33.6 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  35.82 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  32.98 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  36.29 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  32.49 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  33.16 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  31.67 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  33.71 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  35.75 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  31.98 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  34.82 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  33.51 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  34.61 
 
 		 377 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  33.93 
 
 		 377 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  34.1 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  33.85 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  34.18 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  34.99 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  33.69 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  30.53 
 
 		 424 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  32.74 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  29.27 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  29.27 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  29.23 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  32.74 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  32.45 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  31.76 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  31.86 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  32.15 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  31.86 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  32.15 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  31.86 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  32.26 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  27.75 
 
 		 427 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  28.37 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  26.46 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  25.59 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  26.15 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  26.15 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  34.48 
 
 		 490 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  28.54 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  37.04 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  41.24 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  45.16 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.15 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  24.24 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  23.56 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.37 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  25.47 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  24 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.12 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  39.81 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  37.08 
 
 		 497 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  22.17 
 
 		 461 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.71 
 
 		 486 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  24.64 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  29.57 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  46.77 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  24.41 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.3 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.48 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  41.27 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  33.82 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.3 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.3 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  40.66 
 
 		 587 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  41.94 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  29.67 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  39.22 
 
 		 577 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  38.83 
 
 		 587 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  29.03 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  47.62 
 
 		 567 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.55 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.75 
 
 		 569 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  43.06 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  24.4 
 
 		 484 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  44.44 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.76 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  32.99 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>