More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4254 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  100 
 
 		 395 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  84.95 
 
 		 395 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  45.43 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  40.16 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  43.67 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  42.78 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  38.51 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  41.01 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  39.95 
 
 		 412 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  37.14 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  37.25 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  38.38 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  37.73 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  37.14 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  37.43 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  41.35 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  36.69 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  37.46 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  40.31 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  39.58 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  40.74 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  36.57 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  37.14 
 
 		 366 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  36.86 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  37.14 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  39.04 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  37.14 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  40 
 
 		 402 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  38.44 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  38.44 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  38.44 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  38.44 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  38.44 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  36.32 
 
 		 427 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  38.8 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  36.29 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  35.81 
 
 		 423 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  36.27 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  40.34 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  40.62 
 
 		 377 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  40.06 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  40.06 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  40.06 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  35.49 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  37.9 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  34.13 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  38.08 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  34.45 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  29.63 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  29.63 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  43.48 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  43.48 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  43.48 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  43.48 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  40.91 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0767  amidohydrolase 3  53.33 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.407111  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  37.09 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  46.07 
 
 		 579 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3590  dihydroorotase  50 
 
 		 574 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.65 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  40.22 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  40.22 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  40.22 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5269  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.92 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  0.0756976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  40.22 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  40.22 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  40.22 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  41.3 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  35.29 
 
 		 580 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.79 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0312  amidohydrolase 3  42.2 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  44.94 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.62 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  47.54 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  50.79 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  43.82 
 
 		 497 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.54 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  39.82 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  43.18 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0609  amidohydrolase 3  45.45 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0622  amidohydrolase 3  45.45 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  31.09 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0136  amidohydrolase 3  48.86 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.403062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0600  amidohydrolase 3  45.45 
 
 		 573 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.36 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  39.8 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  34.31 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  36 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0688  dihydroorotase  42.53 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  48.44 
 
 		 470 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.41 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.54 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  39.58 
 
 		 490 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.94 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 560 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  44.32 
 
 		 583 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4344  amidohydrolase  35.92 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.574797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.26 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>