59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4689 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  95.9 
 
 
366 aa  720    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  96.72 
 
 
366 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  97.27 
 
 
366 aa  728    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  95.9 
 
 
366 aa  720    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  96.17 
 
 
366 aa  722    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  96.17 
 
 
366 aa  720    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  96.72 
 
 
366 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  96.72 
 
 
366 aa  724    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  96.17 
 
 
366 aa  720    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  100 
 
 
366 aa  746    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  47.55 
 
 
377 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  44.75 
 
 
378 aa  303  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  47.26 
 
 
377 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  47.26 
 
 
377 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  46.97 
 
 
377 aa  299  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  46.69 
 
 
377 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  46.4 
 
 
377 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  43.8 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  42.15 
 
 
379 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  43.66 
 
 
377 aa  275  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  42.22 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  37.32 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  36.29 
 
 
395 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  34.32 
 
 
379 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  35.1 
 
 
403 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  33.71 
 
 
404 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  34.25 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  33.33 
 
 
402 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  34.05 
 
 
425 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  32.29 
 
 
383 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  33.03 
 
 
379 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  31.86 
 
 
426 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  29.64 
 
 
412 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  28.15 
 
 
387 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  28.15 
 
 
387 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  28.15 
 
 
387 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  28.15 
 
 
387 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  31.27 
 
 
431 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  28.15 
 
 
387 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.91 
 
 
412 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  30.72 
 
 
427 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  29.38 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  28.7 
 
 
423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  25.63 
 
 
420 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  27.52 
 
 
417 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  27.49 
 
 
414 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  24.8 
 
 
427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  26.2 
 
 
424 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  24.73 
 
 
420 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  25.73 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3337  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.62 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5030  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.62 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  28.15 
 
 
577 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.4 
 
 
400 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5254  N-acyl-D-amino-acid deacylase  34.62 
 
 
478 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1900  D-aminoacylase domain-containing protein  31.65 
 
 
589 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0350811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  32.58 
 
 
1059 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  36.84 
 
 
534 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.51 
 
 
429 aa  42.7  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>