251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0558 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  100 
 
 		 425 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  73 
 
 		 426 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  42.82 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  42.78 
 
 		 395 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  39.01 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  39.08 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  36.39 
 
 		 379 aa  206  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  33.59 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  33.33 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  34.38 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  30.26 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  33.93 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  33.24 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  30.79 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  30.79 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  30.79 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  33.51 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  30.79 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  30.79 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  33.33 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  35.43 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  34.67 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  34.1 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  33.94 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  35.53 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  34.3 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  31.9 
 
 		 417 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  34.97 
 
 		 366 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  32.32 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  34.66 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  34.97 
 
 		 366 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  31.55 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  32.89 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  33.24 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  33.07 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  34.97 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  33.77 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  34.36 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  34.05 
 
 		 366 aa  170  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  34.58 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  32.89 
 
 		 377 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  33.59 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  34.58 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  34.05 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  34.58 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  31.23 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  33.16 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  31.03 
 
 		 424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  29.76 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  29.95 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  41.57 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  40.38 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.62 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  34.48 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1551  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.03 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  36.36 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  39.6 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.85 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  37.5 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  39.18 
 
 		 490 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  54.69 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  44.44 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  45.45 
 
 		 482 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.92 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  33.33 
 
 		 428 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  40.98 
 
 		 431 aa  53.9  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  24.4 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.88 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  50 
 
 		 436 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.7 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1862  D-aminoacylase domain-containing protein  35.71 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.555174  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  28.03 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3315  amidohydrolase 3  40.21 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0820115 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  24.4 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  24.16 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  33.94 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  22.93 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  41 
 
 		 577 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3006  Amidohydrolase 3  34.23 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  44.26 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  43.28 
 
 		 477 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.51 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.25 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  45.68 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 590 aa  50.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  38.2 
 
 		 604 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3037  amidohydrolase 3  37.76 
 
 		 587 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.98 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  36.07 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  46.88 
 
 		 467 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  42.62 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  35.87 
 
 		 601 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  35.96 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1022  amidohydrolase 3  41.27 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>