89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4833 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  99.74 
 
 
387 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  100 
 
 
387 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  100 
 
 
387 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  100 
 
 
387 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  100 
 
 
387 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  38.44 
 
 
395 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  36 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  32.44 
 
 
370 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  35.47 
 
 
383 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  33.07 
 
 
379 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  33.86 
 
 
379 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  31.89 
 
 
412 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  30.79 
 
 
425 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  33.16 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  33.96 
 
 
379 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  32.76 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  33.05 
 
 
404 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.09 
 
 
412 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  30.46 
 
 
423 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  32.05 
 
 
417 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  32.18 
 
 
402 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  32.92 
 
 
377 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  30.69 
 
 
427 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  30.24 
 
 
378 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  33.13 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  30.81 
 
 
431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  31.2 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  33.33 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  31.91 
 
 
402 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  31.86 
 
 
377 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  32.49 
 
 
377 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  31.86 
 
 
377 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  31.86 
 
 
377 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  31.55 
 
 
377 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  29.62 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  28.45 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  28.45 
 
 
366 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  29.03 
 
 
366 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  28.45 
 
 
366 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  28.74 
 
 
366 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  28.74 
 
 
366 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  28.45 
 
 
366 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  28.15 
 
 
366 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  28.45 
 
 
366 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  26.35 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  25.74 
 
 
425 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  30.18 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  24.94 
 
 
427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  25 
 
 
420 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  25.37 
 
 
420 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  46.77 
 
 
431 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.94 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  34.33 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.98 
 
 
426 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.07 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  37.1 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  37.1 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  32.71 
 
 
530 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.49 
 
 
497 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.84 
 
 
497 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 
424 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  31.82 
 
 
497 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.78 
 
 
436 aa  46.2  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.78 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  23.68 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.71 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  40.28 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  35.79 
 
 
601 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.84 
 
 
432 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  35.06 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.51 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4361  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.62 
 
 
531 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  37.1 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  30.39 
 
 
481 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  38.33 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  40.32 
 
 
439 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2013  dihydroorotase  36.26 
 
 
566 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  33.33 
 
 
386 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  34.83 
 
 
560 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3252  N-acyl-D-amino-acid deacylase  29.46 
 
 
527 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.516885  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.71 
 
 
427 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  28.57 
 
 
593 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  29.51 
 
 
534 aa  43.1  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  35.96 
 
 
587 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.34 
 
 
431 aa  42.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  35.29 
 
 
436 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>