61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0919 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  100 
 
 
377 aa  767    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  80.64 
 
 
377 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  79.58 
 
 
377 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  79.58 
 
 
377 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  79.31 
 
 
377 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  79.31 
 
 
377 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  77.72 
 
 
377 aa  607  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  66.49 
 
 
379 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  66.84 
 
 
377 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  58.09 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  43.8 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  44.09 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  43.52 
 
 
366 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  43.52 
 
 
366 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  43.23 
 
 
366 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  42.94 
 
 
366 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  42.94 
 
 
366 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  42.94 
 
 
366 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  42.65 
 
 
366 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  42.65 
 
 
366 aa  276  6e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  43.35 
 
 
370 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  37.9 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  36.08 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  37.03 
 
 
403 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  37.03 
 
 
404 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  35.34 
 
 
402 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  37.53 
 
 
395 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  36.62 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
425 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  35.75 
 
 
426 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  33.85 
 
 
431 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  31.84 
 
 
379 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  33.13 
 
 
387 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  33.13 
 
 
387 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  33.13 
 
 
387 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  33.13 
 
 
387 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  33.13 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  32.89 
 
 
379 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  32.06 
 
 
412 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  30.33 
 
 
412 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  32.99 
 
 
427 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  33.72 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  29.93 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  30.91 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  27.91 
 
 
427 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  27.63 
 
 
424 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  28.47 
 
 
420 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.76 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  27.46 
 
 
417 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  27.53 
 
 
414 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  32 
 
 
474 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  23.78 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01890  conserved hypothetical protein  44.07 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  36.51 
 
 
579 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  39.68 
 
 
532 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  33.78 
 
 
407 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  35.87 
 
 
560 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  35.11 
 
 
491 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  34.38 
 
 
479 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  32.14 
 
 
444 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  30.95 
 
 
444 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>