59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4376 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  100 
 
 		 379 aa  773    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  66.23 
 
 		 377 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  66.23 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  66.49 
 
 		 377 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  66.49 
 
 		 377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  65.96 
 
 		 377 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  65.96 
 
 		 377 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  65.7 
 
 		 377 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  61.11 
 
 		 378 aa  481  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  63.32 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  43.25 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  43.25 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  42.7 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  42.7 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  42.7 
 
 		 366 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  42.42 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  42.15 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  42.42 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  42.15 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  42.78 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  39.89 
 
 		 370 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  38.8 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.87 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  36.72 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  37.46 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  37.22 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  36.96 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  38.46 
 
 		 383 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  31.91 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  33.96 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.94 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  33.64 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  34.99 
 
 		 426 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  32.8 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  31.79 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  32.66 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  31.93 
 
 		 427 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  32.13 
 
 		 412 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  30.05 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  29.16 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  30.61 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  28.86 
 
 		 417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  30.85 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  28.99 
 
 		 424 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  29.44 
 
 		 423 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  27.68 
 
 		 420 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.43 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  42.47 
 
 		 445 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  41.11 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  26.07 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  46.51 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  40.91 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  36 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  22.25 
 
 		 475 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  23.55 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  39.39 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>