74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4825 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  98.41 
 
 		 377 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  98.94 
 
 		 377 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  98.41 
 
 		 377 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  100 
 
 		 377 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  97.88 
 
 		 377 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  83.82 
 
 		 377 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  79.58 
 
 		 377 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  65.7 
 
 		 379 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  66.76 
 
 		 377 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  58.09 
 
 		 378 aa  471  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  47.84 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  47.26 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  46.97 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  46.97 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  46.97 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  46.97 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  46.97 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  46.69 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  46.4 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  46.4 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  37.17 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  40.06 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.38 
 
 		 395 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  36.08 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  36.26 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  36.42 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  35.29 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  36.72 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  34.82 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  33.85 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.07 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  31.48 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  30.34 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  33.16 
 
 		 431 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  30.81 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.68 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  32.1 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  29.83 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  28.4 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  30.69 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  31.52 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  27.45 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.7 
 
 		 420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  27.46 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  26.87 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  35.23 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.11 
 
 		 560 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  33.33 
 
 		 568 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  24.07 
 
 		 474 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  28.57 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  41.18 
 
 		 532 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  39.33 
 
 		 533 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.79 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  32.95 
 
 		 579 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  39.68 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  39.68 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  39.68 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  39.68 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  46.51 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0633495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  38.1 
 
 		 453 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  38.1 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.63 
 
 		 494 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  38.81 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  38.1 
 
 		 453 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  38.1 
 
 		 453 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  38.1 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  22.4 
 
 		 574 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  35.48 
 
 		 577 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0926  D-aminoacylase  35.23 
 
 		 490 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.888276  normal  0.961635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>