201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2453 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  74.53 
 
 		 427 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  100 
 
 		 423 aa  873    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  62.62 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  63.98 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  59.95 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  54.52 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  49.12 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  36.22 
 
 		 395 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  35.81 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.79 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  33.09 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  31.6 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.24 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  33.5 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  29.81 
 
 		 370 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 387 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 387 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 387 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 387 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  32.56 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  32.56 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  31.5 
 
 		 378 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  31.95 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  32.02 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  30.28 
 
 		 424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  29.95 
 
 		 377 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  30.69 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  30.69 
 
 		 377 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  29.07 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  33.72 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  29.92 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  33.42 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  29.08 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  30.18 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  29.66 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  29.3 
 
 		 425 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  30.19 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  28.84 
 
 		 420 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  29.57 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  29.28 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  29.28 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  29.44 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  28.99 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  28.7 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  28.7 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  28.99 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  28.7 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  28.7 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  28.7 
 
 		 366 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  41.38 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.93 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.08 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.93 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.93 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.21 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.93 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  33.33 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  37.7 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  45.9 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  42.62 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.63 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6214  D-glutamate deacylase  38.46 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  31.96 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.82 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  31.4 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.4 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.18 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.56 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.4 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  27.56 
 
 		 582 aa  53.9  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1820  D-glutamate deacylase  30.39 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  32.41 
 
 		 530 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1479  dihydroorotase  32.79 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284276  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09918  D-glutamate deacylase  33.33 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  33.72 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.03 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3040  D-glutamate deacylase  36.76 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.236527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3836  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase/D-alanyl-D-alanine-endopeptidase  40.54 
 
 		 1076 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  37.5 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  34.34 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.34 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.72 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.71 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.12 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  33.67 
 
 		 587 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  32.56 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.78 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.72 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0576  amidohydrolase 3  33.67 
 
 		 578 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3245  dihydroorotase  34.85 
 
 		 534 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325053  normal  0.0340031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  31.31 
 
 		 629 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  32.56 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.56 
 
 		 434 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0927  N-acyl-D-amino-acid deacylase  31.13 
 
 		 499 aa  49.7  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  35.56 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  42.19 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.78 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  38.71 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>