78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4846 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  98.94 
 
 
377 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  97.88 
 
 
377 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  84.35 
 
 
377 aa  664    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  100 
 
 
377 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  97.88 
 
 
377 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  97.88 
 
 
377 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  79.58 
 
 
377 aa  621  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  65.96 
 
 
379 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  66.49 
 
 
377 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  57.82 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  47.26 
 
 
366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  46.4 
 
 
366 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  46.69 
 
 
366 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  46.4 
 
 
366 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  46.4 
 
 
366 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  46.4 
 
 
366 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  46.4 
 
 
366 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  46.11 
 
 
366 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  45.82 
 
 
366 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  45.82 
 
 
366 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  37.17 
 
 
370 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  40.62 
 
 
395 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.92 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  36.08 
 
 
402 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  36.71 
 
 
404 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  36.26 
 
 
403 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  35.46 
 
 
402 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  37.01 
 
 
383 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  34.47 
 
 
379 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  34.1 
 
 
426 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.07 
 
 
425 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  31.48 
 
 
379 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  33.07 
 
 
431 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  29.82 
 
 
412 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  31.05 
 
 
425 aa  156  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 
387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 
387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 
387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 
387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  31.86 
 
 
387 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  32.29 
 
 
427 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.15 
 
 
412 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  29.83 
 
 
424 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  28.64 
 
 
427 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  30.69 
 
 
423 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  31.25 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  27.7 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.7 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  26.94 
 
 
417 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  26.36 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  35.23 
 
 
587 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  38.14 
 
 
560 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.65 
 
 
532 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  40.45 
 
 
533 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  33.33 
 
 
568 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  28.57 
 
 
390 aa  47  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  24.07 
 
 
474 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  32.95 
 
 
579 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.79 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.71 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  39.68 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  39.68 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  39.68 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  35.16 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  39.68 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  37.1 
 
 
577 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  40.32 
 
 
497 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  46.51 
 
 
446 aa  43.5  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  38.1 
 
 
453 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  26.78 
 
 
389 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.89 
 
 
491 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  38.1 
 
 
453 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  38.1 
 
 
453 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  38.1 
 
 
453 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  38.1 
 
 
453 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  36.17 
 
 
577 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  22.13 
 
 
574 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  29.91 
 
 
530 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>