70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0106 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  100 
 
 		 378 aa  776    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  61.11 
 
 		 379 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  58.89 
 
 		 377 aa  474  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  58.36 
 
 		 377 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  58.09 
 
 		 377 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  57.82 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  58.09 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  58.09 
 
 		 377 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  57.56 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  55.97 
 
 		 377 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  45.3 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  45.3 
 
 		 366 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  44.75 
 
 		 366 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  44.2 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  44.48 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  44.48 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  44.48 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  44.2 
 
 		 366 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  44.2 
 
 		 366 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  43.92 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  41.13 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  37.73 
 
 		 395 aa  238  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  37.27 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  35.64 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  35.61 
 
 		 402 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  36.42 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  37.12 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  34.34 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  32.98 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  32.08 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  34.27 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  30.57 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  32.99 
 
 		 431 aa  172  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  34.7 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  31.5 
 
 		 423 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  33.25 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  31.16 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  31.22 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  29.63 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  28.75 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  27.8 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  28.26 
 
 		 424 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.84 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  27.58 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  23.16 
 
 		 457 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  39.77 
 
 		 530 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  38.46 
 
 		 587 aa  49.7  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  42.86 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  37.76 
 
 		 560 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  27.54 
 
 		 461 aa  46.6  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  23.2 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  27.27 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3646  amidohydrolase 3  35.96 
 
 		 589 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.668872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  27.27 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  23.47 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  37.08 
 
 		 579 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  38.3 
 
 		 577 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  24.17 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  44.26 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2023  amidohydrolase 3  32.98 
 
 		 579 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.730117 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  22.56 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  22.84 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.33 
 
 		 432 aa  43.1  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.3 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>