50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2340 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 389 aa  787    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  99.74 
 
 		 389 aa  784    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  96.66 
 
 		 389 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  98.71 
 
 		 389 aa  781    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  62.11 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  47.87 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  45.13 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  44.5 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  44.73 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  42.97 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  42.16 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  44.44 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  40.71 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 379 aa  296  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  42.93 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  40.83 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 		 390 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  40.83 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  40.83 
 
 		 390 aa  292  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  42.67 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  41.39 
 
 		 390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 		 377 aa  288  8e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.58 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  39.43 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  40.05 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  39.1 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  23.02 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  23.02 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3701  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.5 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0437627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  27.27 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3853  hypothetical protein  62.5 
 
 		 34 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0813  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.21 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0482974  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.84 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2134  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  22.5 
 
 		 380 aa  43.5  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000732825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  34.44 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22930  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.21 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1698  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.86 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.0310593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  23.59 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>