72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1115 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
393 aa  780    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  42.59 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  42.62 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  45.21 
 
 
390 aa  286  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  42.59 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  40.8 
 
 
376 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  43.48 
 
 
389 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  42.06 
 
 
389 aa  275  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  41.02 
 
 
390 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  41.49 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  41.49 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  41.49 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  41.49 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  41.62 
 
 
402 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  45.6 
 
 
390 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  40.55 
 
 
393 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  40.93 
 
 
388 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  40.11 
 
 
390 aa  266  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  266  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  41.9 
 
 
377 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 
390 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  39.84 
 
 
390 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  40.32 
 
 
378 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  36.99 
 
 
379 aa  257  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  41.51 
 
 
391 aa  255  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  39.14 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  38.93 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  39.1 
 
 
389 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  39.1 
 
 
389 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  38.83 
 
 
389 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  39.41 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  37.37 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  38.3 
 
 
389 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  24.38 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.17 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  40.66 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  46.94 
 
 
461 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1477  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.33 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.783308  normal  0.808264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0778  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.33 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  46.67 
 
 
839 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  46.67 
 
 
763 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  46.67 
 
 
1029 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  46.67 
 
 
1029 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  47.17 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  45 
 
 
1024 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  21.05 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  21.05 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  24.17 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  21.05 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  40.54 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  45 
 
 
1024 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  21.05 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  45 
 
 
1029 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6234  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.5 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  45 
 
 
1024 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22930  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  43.64 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  44.44 
 
 
560 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01930  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.33 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3505  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  42.25 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  25.06 
 
 
439 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  39.71 
 
 
504 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.33 
 
 
425 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  28.57 
 
 
425 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  41.82 
 
 
385 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1698  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.85 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.0310593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>