79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1309 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
402 aa  804    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  55.28 
 
 
363 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  48.55 
 
 
389 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  48.28 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  50.13 
 
 
391 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  47.18 
 
 
379 aa  336  5e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  46.93 
 
 
376 aa  332  9e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  46.02 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  43.83 
 
 
402 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  45.38 
 
 
393 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  44.44 
 
 
389 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  44.44 
 
 
389 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  46.34 
 
 
391 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  44.44 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  44.39 
 
 
390 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  43.85 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  43.67 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  46.67 
 
 
376 aa  296  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  40.7 
 
 
395 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  43.34 
 
 
377 aa  293  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  40.74 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 
390 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  43.08 
 
 
378 aa  282  9e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 
390 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 
390 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 
390 aa  281  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 
390 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 
390 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 
390 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 
390 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 
390 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  40.21 
 
 
390 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  40.21 
 
 
390 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  40.21 
 
 
390 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  41.62 
 
 
393 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  41.25 
 
 
393 aa  274  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  23.83 
 
 
460 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  31.01 
 
 
431 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  31.13 
 
 
566 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  25.47 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  36.67 
 
 
425 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  42.62 
 
 
457 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  24.46 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  42.62 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  46.67 
 
 
459 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  35.59 
 
 
569 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  23.79 
 
 
383 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  23.16 
 
 
428 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  32.48 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  32.48 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.49 
 
 
441 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  22.25 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  23.29 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  22.25 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  36.05 
 
 
1005 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  22.25 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  22.25 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  39.34 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  29.79 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0346  amidohydrolase  39.34 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  32.88 
 
 
574 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  29.09 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  22.63 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  31.88 
 
 
567 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  38.3 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  36.78 
 
 
908 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.95 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  42.62 
 
 
472 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  46.67 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  43.33 
 
 
459 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.67 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  30.08 
 
 
443 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2179  dihydroorotase  42.11 
 
 
432 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805984  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  35.87 
 
 
839 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.22 
 
 
400 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  25.25 
 
 
426 aa  43.1  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.58 
 
 
432 aa  43.1  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>