More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2179 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2179  dihydroorotase  100 
 
 
432 aa  879    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805984  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1214  dihydroorotase  55.32 
 
 
433 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  55.88 
 
 
435 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2202  dihydroorotase  55.24 
 
 
428 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4244  dihydroorotase  55.94 
 
 
419 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2264  dihydroorotase  55.24 
 
 
428 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  hitchhiker  0.00053128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1509  dihydroorotase  54.91 
 
 
414 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0486  dihydroorotase  44.26 
 
 
411 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0757955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.43 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.08 
 
 
427 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.7 
 
 
436 aa  270  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  36.02 
 
 
422 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.47 
 
 
425 aa  263  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.66 
 
 
488 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.27 
 
 
430 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  34.91 
 
 
426 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.11 
 
 
431 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.83 
 
 
425 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  36 
 
 
424 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.41 
 
 
424 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.31 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.5 
 
 
432 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.36 
 
 
425 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 
429 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.81 
 
 
425 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.63 
 
 
430 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.75 
 
 
428 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 
429 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.13 
 
 
428 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  34.04 
 
 
428 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  34.82 
 
 
425 aa  249  8e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.81 
 
 
434 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.83 
 
 
425 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 
435 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  35.75 
 
 
436 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.86 
 
 
430 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.83 
 
 
433 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.81 
 
 
441 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.11 
 
 
427 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  35.05 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  35.05 
 
 
433 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.45 
 
 
434 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 
430 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  36.45 
 
 
424 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  35.66 
 
 
432 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.8 
 
 
436 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.8 
 
 
448 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  35.94 
 
 
446 aa  236  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  35.53 
 
 
439 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  33.49 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.82 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  37.35 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  33.41 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  34.98 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  35.08 
 
 
425 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  35.08 
 
 
425 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  34.82 
 
 
433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  35.39 
 
 
425 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  34.98 
 
 
437 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.82 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  36.82 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  36.82 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  36.82 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  36.82 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  36.84 
 
 
425 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  36.82 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  36.82 
 
 
425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  31.75 
 
 
431 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  32.43 
 
 
440 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.59 
 
 
433 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  36.34 
 
 
425 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  33.41 
 
 
436 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  33.18 
 
 
433 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  34.56 
 
 
430 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  35.51 
 
 
438 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.67 
 
 
428 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  35.63 
 
 
425 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  32.67 
 
 
428 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.98 
 
 
433 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  36.32 
 
 
426 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.54 
 
 
497 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 
429 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.92 
 
 
428 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.67 
 
 
428 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.94 
 
 
437 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.54 
 
 
497 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31.76 
 
 
425 aa  227  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  36.71 
 
 
448 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  32.27 
 
 
446 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  32.65 
 
 
442 aa  226  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  30.75 
 
 
440 aa  226  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 
419 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  35.7 
 
 
424 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>