More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0486 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0486  dihydroorotase  100 
 
 
411 aa  819    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0757955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1509  dihydroorotase  51.95 
 
 
414 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2202  dihydroorotase  48.54 
 
 
428 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1214  dihydroorotase  46.93 
 
 
433 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2264  dihydroorotase  48.3 
 
 
428 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  hitchhiker  0.00053128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  46.62 
 
 
435 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2179  dihydroorotase  44.5 
 
 
432 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805984  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4244  dihydroorotase  45.76 
 
 
419 aa  330  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.49 
 
 
436 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  33.49 
 
 
427 aa  209  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.63 
 
 
488 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.15 
 
 
427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  33.17 
 
 
428 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.78 
 
 
434 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.77 
 
 
434 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  34.38 
 
 
424 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  35 
 
 
435 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.37 
 
 
430 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  35.08 
 
 
431 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.17 
 
 
426 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  33.49 
 
 
446 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  33.5 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  33.5 
 
 
425 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  34.38 
 
 
427 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  33.91 
 
 
425 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.2 
 
 
435 aa  188  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.87 
 
 
425 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.77 
 
 
428 aa  186  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.25 
 
 
430 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.31 
 
 
430 aa  186  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 
431 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  29.67 
 
 
439 aa  186  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  33.57 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  31.51 
 
 
422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.16 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  33.57 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.52 
 
 
429 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  34.3 
 
 
438 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  34.36 
 
 
431 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  29.34 
 
 
423 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.3 
 
 
419 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0700  dihydroorotase  34.71 
 
 
421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.336004  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.5 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.62 
 
 
434 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  33.42 
 
 
424 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  33 
 
 
439 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 
433 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.37 
 
 
432 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.27 
 
 
425 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.64 
 
 
419 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.14 
 
 
424 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  33.98 
 
 
425 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  33.81 
 
 
431 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1658  putative dihydroorotase  36.81 
 
 
420 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  33.57 
 
 
432 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  34.43 
 
 
441 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.17 
 
 
433 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.04 
 
 
434 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  33.98 
 
 
433 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  28.93 
 
 
431 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.01 
 
 
425 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.01 
 
 
439 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  28.57 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.52 
 
 
429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  33.49 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.48 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  31.57 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.39 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.2 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  33.25 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.08 
 
 
434 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  32.29 
 
 
433 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  32.59 
 
 
428 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 
458 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.78 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  32.93 
 
 
436 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  33.41 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  33 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.58 
 
 
425 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  32.75 
 
 
425 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  31.51 
 
 
429 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  32.28 
 
 
425 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.87 
 
 
473 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  32.68 
 
 
426 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.24 
 
 
446 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  32.52 
 
 
428 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  32.53 
 
 
433 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  30.27 
 
 
429 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  32.69 
 
 
431 aa  169  7e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.31 
 
 
448 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  30.07 
 
 
440 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  33.17 
 
 
425 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.95 
 
 
427 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.37 
 
 
428 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>