More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1214 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1214  dihydroorotase  100 
 
 
433 aa  880    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2202  dihydroorotase  59.57 
 
 
428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2264  dihydroorotase  59.2 
 
 
428 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  hitchhiker  0.00053128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2179  dihydroorotase  55.32 
 
 
432 aa  491  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805984  normal  0.355095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1509  dihydroorotase  56.26 
 
 
414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  53.81 
 
 
435 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4244  dihydroorotase  53.18 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0486  dihydroorotase  46.93 
 
 
411 aa  330  4e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0757955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.38 
 
 
434 aa  279  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  35.66 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.37 
 
 
425 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.92 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.3 
 
 
429 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.35 
 
 
424 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.28 
 
 
425 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.36 
 
 
425 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.57 
 
 
434 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.57 
 
 
436 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 
430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.91 
 
 
427 aa  236  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.43 
 
 
425 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.3 
 
 
488 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.59 
 
 
419 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.63 
 
 
435 aa  232  9e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.34 
 
 
425 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.07 
 
 
432 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  32 
 
 
430 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  34.45 
 
 
425 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.66 
 
 
430 aa  230  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  35.58 
 
 
439 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  33.81 
 
 
424 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.96 
 
 
424 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.95 
 
 
439 aa  229  9e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 
428 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 
429 aa  227  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
433 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.22 
 
 
426 aa  226  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  33.57 
 
 
431 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  32.55 
 
 
421 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.21 
 
 
420 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.63 
 
 
429 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  32.22 
 
 
431 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.22 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.03 
 
 
430 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  33.81 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  33.33 
 
 
425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  33.89 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.14 
 
 
434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0502  dihydroorotase  35.24 
 
 
417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.06 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  30.75 
 
 
440 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  34.2 
 
 
425 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  33.33 
 
 
428 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  32.94 
 
 
423 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  34.04 
 
 
433 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  33.33 
 
 
425 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.62 
 
 
419 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  33.81 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  29.28 
 
 
440 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  33.81 
 
 
425 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  33.66 
 
 
428 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.06 
 
 
436 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.3 
 
 
441 aa  216  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.18 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.91 
 
 
434 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  32.87 
 
 
446 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  31.69 
 
 
429 aa  216  8e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.81 
 
 
437 aa  216  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.68 
 
 
430 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  34.04 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  33.73 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  31.34 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  29.84 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1426  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.68 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  30.84 
 
 
446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  33.33 
 
 
433 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  33.01 
 
 
425 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  31.88 
 
 
425 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  34.52 
 
 
437 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  33.57 
 
 
425 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.04 
 
 
433 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  32.3 
 
 
425 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  30.39 
 
 
442 aa  211  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  32.71 
 
 
425 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  33.57 
 
 
436 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
431 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  33.73 
 
 
438 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  32.83 
 
 
427 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  32.43 
 
 
435 aa  209  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.1 
 
 
439 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  33.57 
 
 
428 aa  210  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31.84 
 
 
425 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  31.44 
 
 
423 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>