95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2586 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
376 aa  766    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  47.59 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  47.75 
 
 
389 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  47.21 
 
 
389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  46.01 
 
 
363 aa  310  2e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  46.67 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  45.38 
 
 
393 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  44.71 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  45.96 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  40 
 
 
379 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  40.69 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  40.53 
 
 
376 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 
402 aa  279  7e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.58 
 
 
395 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  40.86 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  41.29 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  38.93 
 
 
389 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 
389 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  38.4 
 
 
389 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 
389 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  38.71 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  36.63 
 
 
390 aa  252  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  39.41 
 
 
393 aa  252  7e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  36.19 
 
 
390 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  36.19 
 
 
390 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  36.19 
 
 
390 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  35.92 
 
 
390 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  36.36 
 
 
390 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  35.92 
 
 
390 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  36.36 
 
 
390 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  36.36 
 
 
390 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  36.36 
 
 
390 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  36.1 
 
 
390 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  36.1 
 
 
390 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  36.1 
 
 
390 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  35.83 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  37.17 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  39.5 
 
 
390 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2154  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.09 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  24.21 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  22.74 
 
 
420 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1698  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  40.32 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.0310593 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0741  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  23.97 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0725  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  23.97 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  23.97 
 
 
389 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  28.7 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  21.41 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  21.52 
 
 
584 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  21.59 
 
 
585 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  38.71 
 
 
451 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.71 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  21.52 
 
 
584 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  21.52 
 
 
584 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0360  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.04 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  21.13 
 
 
584 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  25.43 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  23.99 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3701  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.22 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0437627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  33.03 
 
 
436 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  34.33 
 
 
534 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2217  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.85 
 
 
390 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.84 
 
 
432 aa  47  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  24.07 
 
 
432 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0778  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  40.32 
 
 
395 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  24.65 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.1 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  23.13 
 
 
525 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  33.03 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3402  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.43 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000022034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  21.07 
 
 
584 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06750  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  36.36 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000848059  normal  0.767128 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  25.41 
 
 
584 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4174  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  30.77 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0223  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.43 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2863  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  23.21 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1347  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.4 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  24.87 
 
 
601 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.03 
 
 
434 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  23.7 
 
 
1498 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  22.47 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  50 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  30.34 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  30.34 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  41.07 
 
 
908 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.43 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.75 
 
 
418 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3581  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.94 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000376481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  33.93 
 
 
1010 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4487  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.33 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  21.78 
 
 
404 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.74 
 
 
447 aa  43.5  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  33.33 
 
 
457 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  38.1 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  30.34 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  47.5 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>