144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4777 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  99.49 
 
 		 390 aa  787    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  99.49 
 
 		 390 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  99.49 
 
 		 390 aa  787    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  98.97 
 
 		 390 aa  784    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  785    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  98.72 
 
 		 390 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  98.46 
 
 		 390 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 390 aa  791    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  81.03 
 
 		 390 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  81.03 
 
 		 390 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  80.51 
 
 		 390 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  80.51 
 
 		 390 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  98.97 
 
 		 390 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  47.29 
 
 		 393 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  46.79 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  44.96 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  44.82 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 		 377 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  43.65 
 
 		 379 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  44.59 
 
 		 377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  44.06 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  43.12 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  43.15 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  40.51 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  42.08 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  40.51 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  40.92 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  40.36 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  37.8 
 
 		 376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  40.55 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 		 402 aa  265  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  39.84 
 
 		 393 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  35.83 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.48 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  35.42 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  34.69 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3402  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.65 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000022034  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.45 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  43.33 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  43.33 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  25.13 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  37.04 
 
 		 908 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  40.91 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  35.71 
 
 		 1005 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  30.38 
 
 		 686 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.64 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.94 
 
 		 426 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  25.63 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.67 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.53 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  48.89 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  48.89 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  33.33 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  42.86 
 
 		 496 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  50 
 
 		 585 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0289  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.21 
 
 		 362 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.27 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  34.38 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.21 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.73 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  30.33 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.36 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 		 494 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  47.06 
 
 		 533 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0592  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.45 
 
 		 392 aa  46.2  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  29.55 
 
 		 1084 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.84 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  42.62 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  40.38 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  39.34 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  30.51 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  34.21 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  26.75 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  34.52 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2473  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  35.38 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  31.68 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  30.3 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  40.98 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  32.93 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.67 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  44 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  41.27 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  44.44 
 
 		 556 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>