More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1693 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  64.88 
 
 
531 aa  720    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1100    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  52.73 
 
 
542 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.85 
 
 
532 aa  203  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.91 
 
 
560 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
556 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
538 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.01 
 
 
557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
539 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.23 
 
 
564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 
537 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  31.05 
 
 
548 aa  178  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  30.9 
 
 
542 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
546 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  28.77 
 
 
550 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.24 
 
 
543 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.39 
 
 
549 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.42 
 
 
541 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.63 
 
 
527 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.68 
 
 
557 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.96 
 
 
548 aa  170  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.07 
 
 
530 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.86 
 
 
549 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.78 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.95 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.99 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.02 
 
 
553 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.31 
 
 
545 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.09 
 
 
522 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 
530 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  30.28 
 
 
536 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  28 
 
 
648 aa  160  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.94 
 
 
543 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.92 
 
 
539 aa  159  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 
522 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.08 
 
 
544 aa  157  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.41 
 
 
552 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.12 
 
 
543 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  29.4 
 
 
520 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.79 
 
 
522 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.36 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.23 
 
 
522 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.6 
 
 
522 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.6 
 
 
522 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.25 
 
 
533 aa  154  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  29.49 
 
 
512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.49 
 
 
583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.72 
 
 
581 aa  153  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.79 
 
 
522 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  26.8 
 
 
539 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.97 
 
 
546 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.42 
 
 
522 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.86 
 
 
575 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.29 
 
 
539 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.99 
 
 
562 aa  149  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.68 
 
 
575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.09 
 
 
603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.47 
 
 
552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  30.66 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.07 
 
 
520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  30.88 
 
 
536 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.68 
 
 
537 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.75 
 
 
564 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  28.52 
 
 
545 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.12 
 
 
543 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  28.34 
 
 
604 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.28 
 
 
574 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.14 
 
 
522 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.07 
 
 
619 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  26.86 
 
 
581 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.26 
 
 
535 aa  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.26 
 
 
556 aa  143  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  26.62 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.31 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.7 
 
 
573 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.01 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.23 
 
 
522 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  31.43 
 
 
532 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.43 
 
 
522 aa  140  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.36 
 
 
537 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  25.5 
 
 
596 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  26.87 
 
 
579 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  24.95 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.24 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
541 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.01 
 
 
601 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  28.95 
 
 
535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  25.31 
 
 
592 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  28.71 
 
 
532 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.09 
 
 
560 aa  134  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.45 
 
 
543 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  26.27 
 
 
537 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  29.41 
 
 
475 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  25.18 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  26.4 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  25.93 
 
 
569 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  29.08 
 
 
535 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>