More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3425 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 491 aa  928    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  50.2 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  51.05 
 
 		 536 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  46.83 
 
 		 505 aa  342  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  43.44 
 
 		 509 aa  292  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  41.72 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  42.68 
 
 		 508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 		 513 aa  250  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  38.52 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  38.27 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  32.42 
 
 		 527 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.19 
 
 		 543 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 532 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 556 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.71 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.98 
 
 		 537 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.98 
 
 		 552 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.54 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28 
 
 		 557 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 619 aa  143  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.26 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.72 
 
 		 568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 535 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.44 
 
 		 536 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.84 
 
 		 548 aa  136  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.17 
 
 		 556 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 553 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  33.78 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.5 
 
 		 565 aa  134  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 563 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.66 
 
 		 546 aa  133  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.92 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.81 
 
 		 542 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 554 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.75 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.53 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.84 
 
 		 560 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 547 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.87 
 
 		 544 aa  124  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.47 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 538 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 544 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 477 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.9 
 
 		 542 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.72 
 
 		 560 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 539 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 543 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.24 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.66 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.21 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 584 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.24 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.16 
 
 		 555 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  34.85 
 
 		 532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.43 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.87 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.48 
 
 		 569 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.85 
 
 		 540 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.42 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.57 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.36 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  31.67 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.58 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 		 552 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.9 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  29.85 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.85 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.51 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.51 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.51 
 
 		 522 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.2 
 
 		 579 aa  104  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.67 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.86 
 
 		 522 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  30.48 
 
 		 558 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  25.51 
 
 		 541 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.56 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  30.37 
 
 		 551 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 521 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.28 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.64 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 563 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 537 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  25.38 
 
 		 568 aa  100  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 620 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.32 
 
 		 560 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.33 
 
 		 576 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 552 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.82 
 
 		 525 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.52 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>