More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1172 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  100 
 
 
560 aa  1146    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  96.61 
 
 
543 aa  1098    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  44.99 
 
 
565 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  43.17 
 
 
608 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  42.47 
 
 
613 aa  428  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  42.93 
 
 
574 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  35.77 
 
 
564 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  37 
 
 
569 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  34.84 
 
 
573 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  36.79 
 
 
569 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  36.89 
 
 
576 aa  296  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  35.41 
 
 
564 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
573 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  35.66 
 
 
575 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  33.57 
 
 
544 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.73 
 
 
569 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  36.59 
 
 
542 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34.84 
 
 
542 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  33.46 
 
 
529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 
553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.34 
 
 
574 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  29.42 
 
 
596 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.02 
 
 
616 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.36 
 
 
530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.92 
 
 
543 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  31.83 
 
 
583 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.09 
 
 
522 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  31.38 
 
 
583 aa  209  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.55 
 
 
544 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  28.73 
 
 
522 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.62 
 
 
556 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 
603 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  31.6 
 
 
585 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.8 
 
 
535 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31.28 
 
 
580 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.76 
 
 
520 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.73 
 
 
522 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.04 
 
 
541 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.98 
 
 
556 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.59 
 
 
539 aa  203  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.17 
 
 
601 aa  202  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.36 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.92 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.36 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  30.99 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.45 
 
 
545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.84 
 
 
522 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.94 
 
 
522 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.02 
 
 
522 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.55 
 
 
522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.52 
 
 
576 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 
584 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  27.02 
 
 
520 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.68 
 
 
580 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.89 
 
 
538 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.1 
 
 
538 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.39 
 
 
583 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.66 
 
 
537 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.21 
 
 
580 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.21 
 
 
582 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  28.65 
 
 
563 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.69 
 
 
532 aa  191  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.61 
 
 
564 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  28.65 
 
 
563 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  29.6 
 
 
560 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  29.79 
 
 
563 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.96 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  30.37 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.44 
 
 
558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.28 
 
 
537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.66 
 
 
549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
589 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
606 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.12 
 
 
563 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 
527 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.32 
 
 
547 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  29.39 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.01 
 
 
565 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.74 
 
 
583 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.05 
 
 
522 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.76 
 
 
620 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.88 
 
 
533 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.18 
 
 
543 aa  170  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.67 
 
 
546 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  30.6 
 
 
536 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  30.6 
 
 
536 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  30.6 
 
 
536 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  26.69 
 
 
568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.59 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.42 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.72 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.72 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  32.36 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.72 
 
 
583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.78 
 
 
539 aa  163  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.86 
 
 
543 aa  162  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.5 
 
 
601 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  28.3 
 
 
537 aa  161  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>