More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0990 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  100 
 
 		 563 aa  1155    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  78.89 
 
 		 563 aa  937    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  62.48 
 
 		 568 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  78.89 
 
 		 563 aa  938    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  50.65 
 
 		 580 aa  580  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3491  urease domain protein  52.45 
 
 		 266 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.89 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  31.09 
 
 		 603 aa  216  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 569 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  28.98 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.89 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  44.19 
 
 		 256 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.73 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.7 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.83 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  28.73 
 
 		 565 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 564 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 616 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.99 
 
 		 560 aa  189  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.26 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.09 
 
 		 576 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 535 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.98 
 
 		 569 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.39 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.16 
 
 		 541 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.59 
 
 		 573 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.99 
 
 		 543 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  28.73 
 
 		 538 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 538 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  29.5 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 573 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 601 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 527 aa  174  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 589 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.88 
 
 		 596 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 544 aa  170  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  27.51 
 
 		 544 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  26.12 
 
 		 558 aa  170  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  27.38 
 
 		 580 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.3 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 582 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  26.72 
 
 		 585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.88 
 
 		 539 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  27.55 
 
 		 580 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 590 aa  163  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 		 584 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.41 
 
 		 575 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.41 
 
 		 575 aa  160  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.78 
 
 		 560 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.42 
 
 		 544 aa  156  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 606 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.38 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.38 
 
 		 583 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  27.53 
 
 		 576 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 529 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 556 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.6 
 
 		 543 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  26.51 
 
 		 537 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 551 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  27.75 
 
 		 583 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.3 
 
 		 583 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 544 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 556 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.26 
 
 		 546 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.03 
 
 		 530 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  26.63 
 
 		 601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  25.58 
 
 		 575 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.07 
 
 		 579 aa  148  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 583 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.88 
 
 		 556 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.25 
 
 		 557 aa  147  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  26.24 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.26 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.65 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 543 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 619 aa  144  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 553 aa  144  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26 
 
 		 547 aa  143  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 560 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.52 
 
 		 550 aa  143  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 552 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.43 
 
 		 522 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  26.71 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.48 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.6 
 
 		 544 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.05 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.24 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.87 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  25.61 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.39 
 
 		 522 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  26.97 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 550 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>