More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3406 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  100 
 
 		 550 aa  1130    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  64.91 
 
 		 556 aa  751    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  63.72 
 
 		 619 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  72.63 
 
 		 548 aa  837    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  56.34 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  54.12 
 
 		 553 aa  610  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  47.62 
 
 		 565 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  48.29 
 
 		 546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  44.85 
 
 		 552 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  46.14 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  46.46 
 
 		 553 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  44.3 
 
 		 543 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  38.49 
 
 		 568 aa  364  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  41.4 
 
 		 554 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.82 
 
 		 540 aa  354  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  41.72 
 
 		 536 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  40.42 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  36.4 
 
 		 544 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  36.1 
 
 		 532 aa  325  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  41.93 
 
 		 536 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  38.19 
 
 		 563 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  39.33 
 
 		 522 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  35.34 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  40.38 
 
 		 532 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  41.41 
 
 		 532 aa  306  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.26 
 
 		 556 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  35.86 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  35.46 
 
 		 530 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  35.8 
 
 		 527 aa  295  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 556 aa  292  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  34.64 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  36.74 
 
 		 544 aa  283  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  32.03 
 
 		 539 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  34.41 
 
 		 543 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  33.54 
 
 		 520 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  31.18 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.45 
 
 		 522 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.7 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  31.37 
 
 		 522 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.66 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.66 
 
 		 522 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  31.31 
 
 		 522 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 522 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.33 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  31.54 
 
 		 522 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 542 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 533 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.72 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.75 
 
 		 553 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 535 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.51 
 
 		 537 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.32 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  32.71 
 
 		 485 aa  220  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 573 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.12 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 539 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.13 
 
 		 549 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.63 
 
 		 543 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 544 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.01 
 
 		 544 aa  203  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.18 
 
 		 541 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.73 
 
 		 548 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 582 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  33.85 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  30.18 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.72 
 
 		 576 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.97 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 547 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.78 
 
 		 569 aa  196  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 537 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.11 
 
 		 601 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.09 
 
 		 527 aa  190  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 475 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.78 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  31.74 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 541 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.66 
 
 		 603 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.32 
 
 		 620 aa  183  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 549 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.85 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.27 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.04 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 549 aa  180  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 550 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.13 
 
 		 558 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.81 
 
 		 543 aa  179  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>