More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0463 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  100 
 
 		 552 aa  1133    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  55.98 
 
 		 546 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  51.93 
 
 		 565 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  48.82 
 
 		 560 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  46.7 
 
 		 556 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  46.52 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  44.66 
 
 		 619 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  44.85 
 
 		 550 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  45.35 
 
 		 553 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  42.88 
 
 		 557 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  44.4 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  40.76 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  43.61 
 
 		 554 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  38.72 
 
 		 568 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  37.17 
 
 		 544 aa  352  8.999999999999999e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  39.19 
 
 		 540 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  39.43 
 
 		 565 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  38 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  36.59 
 
 		 522 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  36.89 
 
 		 563 aa  300  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  37.68 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  38.43 
 
 		 536 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  36.09 
 
 		 527 aa  296  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  34.91 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.11 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  35.69 
 
 		 583 aa  287  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.97 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.64 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  38.82 
 
 		 532 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  39.45 
 
 		 532 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  34.35 
 
 		 556 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  33.85 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 569 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 539 aa  252  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  30.38 
 
 		 522 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.47 
 
 		 542 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.19 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 589 aa  237  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  30.49 
 
 		 522 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  30.49 
 
 		 522 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.13 
 
 		 522 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  30.49 
 
 		 522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.94 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  31.91 
 
 		 553 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.71 
 
 		 522 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.25 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.48 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  29.73 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.36 
 
 		 542 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 538 aa  216  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.17 
 
 		 535 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 544 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 545 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.28 
 
 		 552 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.4 
 
 		 543 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 537 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.63 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.39 
 
 		 544 aa  197  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  30.15 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 573 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 549 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 541 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 564 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 538 aa  191  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.83 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 501 aa  189  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.29 
 
 		 543 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  29.98 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.58 
 
 		 526 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 548 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 589 aa  180  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  27.82 
 
 		 583 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  27.82 
 
 		 583 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 550 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  27.55 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>