More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1040 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  100 
 
 
590 aa  1168    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  34.19 
 
 
583 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  35.52 
 
 
537 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  34.87 
 
 
536 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  34.87 
 
 
536 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  34.87 
 
 
536 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 
584 aa  243  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.11 
 
 
575 aa  213  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.93 
 
 
575 aa  211  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.36 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  32.97 
 
 
620 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 
569 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  31.56 
 
 
586 aa  183  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.55 
 
 
538 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.11 
 
 
581 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  31.3 
 
 
625 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  29.12 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  31.38 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  31.38 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  29.27 
 
 
604 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 
543 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.6 
 
 
535 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.2 
 
 
581 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.35 
 
 
539 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 
587 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.83 
 
 
564 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.78 
 
 
541 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.48 
 
 
563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  30.74 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.14 
 
 
573 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  29.29 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 
556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  31.35 
 
 
542 aa  163  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  31.72 
 
 
650 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.77 
 
 
564 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  27.32 
 
 
585 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  31.69 
 
 
648 aa  156  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 
537 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.54 
 
 
543 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 
520 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.27 
 
 
543 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.06 
 
 
574 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.86 
 
 
563 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.36 
 
 
563 aa  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 
544 aa  153  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.1 
 
 
542 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.45 
 
 
569 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.39 
 
 
537 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.84 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.96 
 
 
530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.86 
 
 
576 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.02 
 
 
539 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  28.33 
 
 
568 aa  146  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.05 
 
 
560 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 
549 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.71 
 
 
560 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.88 
 
 
560 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  25.62 
 
 
580 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  32.03 
 
 
556 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  31.28 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.12 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.51 
 
 
576 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
540 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.87 
 
 
560 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  26.96 
 
 
546 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  29.53 
 
 
555 aa  138  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  26.38 
 
 
613 aa  137  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  29.84 
 
 
554 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  26.7 
 
 
608 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  29.18 
 
 
573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 
532 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  28.92 
 
 
574 aa  133  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  25.4 
 
 
558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.06 
 
 
544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  30.95 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.57 
 
 
564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29.25 
 
 
555 aa  132  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  26.8 
 
 
582 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
542 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.6 
 
 
589 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.23 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  27.39 
 
 
565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  29.65 
 
 
547 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  25.22 
 
 
592 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.53 
 
 
543 aa  126  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  26.43 
 
 
553 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.91 
 
 
616 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.89 
 
 
530 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  28.12 
 
 
547 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  26.86 
 
 
638 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.44 
 
 
540 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.01 
 
 
552 aa  123  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.29 
 
 
552 aa  123  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  27.88 
 
 
564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  24.49 
 
 
597 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  28.13 
 
 
544 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  22.87 
 
 
576 aa  121  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>