More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0742 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  74.72 
 
 
537 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  100 
 
 
536 aa  1079    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  100 
 
 
536 aa  1079    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  100 
 
 
536 aa  1079    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  40.47 
 
 
584 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  41.18 
 
 
569 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  40.3 
 
 
556 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  39.68 
 
 
586 aa  325  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  36.75 
 
 
583 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.5 
 
 
575 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.31 
 
 
575 aa  300  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  34.44 
 
 
601 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  32.07 
 
 
604 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  34.87 
 
 
590 aa  249  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  31.93 
 
 
601 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  32.92 
 
 
555 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  32.09 
 
 
625 aa  229  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  32.67 
 
 
555 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  29.58 
 
 
581 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  30.81 
 
 
552 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  33.39 
 
 
545 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.2 
 
 
556 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
554 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  33.99 
 
 
554 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.02 
 
 
538 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  31.45 
 
 
557 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 
553 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  31.83 
 
 
547 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  30.95 
 
 
648 aa  203  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.94 
 
 
547 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  31.32 
 
 
650 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.73 
 
 
564 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 
603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.17 
 
 
539 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.75 
 
 
581 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 
587 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  31.06 
 
 
547 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.37 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  31.43 
 
 
544 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  27.08 
 
 
577 aa  188  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.1 
 
 
541 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  30.51 
 
 
542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  31.32 
 
 
620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.51 
 
 
527 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28 
 
 
520 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.3 
 
 
556 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.04 
 
 
585 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 
638 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  30.62 
 
 
539 aa  177  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
583 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  30.54 
 
 
583 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
569 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.58 
 
 
548 aa  173  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 
624 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29.03 
 
 
606 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.25 
 
 
564 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  26.87 
 
 
563 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.85 
 
 
537 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.7 
 
 
544 aa  170  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.6 
 
 
560 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.79 
 
 
543 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.73 
 
 
549 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.98 
 
 
616 aa  168  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.27 
 
 
589 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.79 
 
 
574 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.6 
 
 
543 aa  167  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.27 
 
 
569 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  26.71 
 
 
592 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.85 
 
 
541 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  31.09 
 
 
548 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.83 
 
 
546 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.27 
 
 
582 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
549 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.7 
 
 
532 aa  158  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.43 
 
 
543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.18 
 
 
543 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
565 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.48 
 
 
564 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.57 
 
 
576 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.77 
 
 
560 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 
545 aa  153  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.25 
 
 
569 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  26.2 
 
 
626 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.19 
 
 
596 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.05 
 
 
522 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.93 
 
 
533 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  24.51 
 
 
597 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
564 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29 
 
 
530 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.56 
 
 
535 aa  150  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 
545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  27.89 
 
 
580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.65 
 
 
583 aa  147  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  23.67 
 
 
576 aa  146  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.45 
 
 
560 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 
618 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 
525 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  26.61 
 
 
580 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>