More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3625 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  83.81 
 
 		 569 aa  926    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  100 
 
 		 556 aa  1120    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  55.85 
 
 		 586 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  40.3 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  40.3 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  40.3 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  39.1 
 
 		 537 aa  323  6e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.97 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.71 
 
 		 584 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.67 
 
 		 556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.77 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.45 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.22 
 
 		 575 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 554 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 601 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.62 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.93 
 
 		 604 aa  150  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  27.66 
 
 		 587 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  30.24 
 
 		 555 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  30.85 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 555 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.04 
 
 		 542 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  28.62 
 
 		 638 aa  145  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  30.71 
 
 		 547 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 542 aa  144  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 648 aa  144  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 537 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  26.65 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  30.42 
 
 		 539 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 564 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  25.72 
 
 		 576 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 553 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.29 
 
 		 581 aa  136  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 525 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  27.09 
 
 		 624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 625 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.29 
 
 		 581 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 548 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 650 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.65 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 557 aa  120  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  24.45 
 
 		 563 aa  120  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 554 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 		 543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  35.93 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.91 
 
 		 569 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  22.69 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.11 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.87 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 552 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  24.43 
 
 		 618 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  25.18 
 
 		 597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.26 
 
 		 527 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.53 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 		 527 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 596 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 532 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.46 
 
 		 606 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 616 aa  107  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2102  amidohydrolase 3  24.32 
 
 		 928 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.81 
 
 		 530 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  24.42 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.23 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 564 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  24.66 
 
 		 626 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  24.95 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 556 aa  104  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.64 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3968  amidohydrolase 3  23.04 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.09 
 
 		 545 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.52 
 
 		 585 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  23.87 
 
 		 568 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.9 
 
 		 569 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.39 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  24.26 
 
 		 556 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.32 
 
 		 553 aa  99.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.57 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.19 
 
 		 583 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.35 
 
 		 550 aa  98.2  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.12 
 
 		 549 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>