More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1541 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  61.02 
 
 		 650 aa  726    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  100 
 
 		 648 aa  1301    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  52.87 
 
 		 601 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  50.97 
 
 		 604 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  48.85 
 
 		 581 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  49.3 
 
 		 581 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  46.23 
 
 		 585 aa  506  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  46.79 
 
 		 587 aa  490  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  42.99 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  38.29 
 
 		 592 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  34.36 
 
 		 563 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  32.04 
 
 		 564 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.42 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.37 
 
 		 584 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  32.66 
 
 		 537 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 539 aa  208  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  30.95 
 
 		 536 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  30.95 
 
 		 536 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  30.95 
 
 		 536 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  29.33 
 
 		 545 aa  196  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.75 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.75 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.16 
 
 		 564 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.92 
 
 		 575 aa  190  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  31.44 
 
 		 547 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.97 
 
 		 538 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.09 
 
 		 574 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.79 
 
 		 545 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 542 aa  180  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 556 aa  181  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.18 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.89 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  28.55 
 
 		 555 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.18 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.06 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29 
 
 		 543 aa  174  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 537 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 546 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29.36 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.16 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 539 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 579 aa  164  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.62 
 
 		 544 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.66 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  28 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.47 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.17 
 
 		 547 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  30.04 
 
 		 544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 603 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 556 aa  157  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.81 
 
 		 560 aa  157  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.46 
 
 		 544 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  31.75 
 
 		 590 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.94 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.85 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 		 557 aa  154  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 548 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 520 aa  154  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.95 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  30.78 
 
 		 586 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 554 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.06 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 616 aa  150  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 569 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.09 
 
 		 543 aa  148  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.16 
 
 		 553 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 527 aa  147  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.72 
 
 		 552 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 537 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  27.29 
 
 		 531 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  28.5 
 
 		 539 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 620 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.25 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  29.92 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.02 
 
 		 526 aa  140  8.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  27.26 
 
 		 529 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.84 
 
 		 564 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 606 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.11 
 
 		 522 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.96 
 
 		 527 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.78 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  26.1 
 
 		 568 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 520 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  27.51 
 
 		 569 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>