More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0927 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  100 
 
 		 582 aa  1198    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  41.39 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  41.39 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  41.14 
 
 		 543 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  40.54 
 
 		 620 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  39.45 
 
 		 606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  37.02 
 
 		 576 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  35.55 
 
 		 560 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  34.12 
 
 		 560 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  31.81 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32 
 
 		 542 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.76 
 
 		 542 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.91 
 
 		 603 aa  223  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 558 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  30.94 
 
 		 564 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.25 
 
 		 541 aa  220  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 616 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 		 569 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 539 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.08 
 
 		 596 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.99 
 
 		 601 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.66 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.95 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 569 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.89 
 
 		 576 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.6 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.57 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 		 584 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.55 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 545 aa  198  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 573 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  30.21 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  32.14 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.66 
 
 		 565 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.44 
 
 		 537 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 564 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.11 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 556 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.87 
 
 		 608 aa  187  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 613 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.25 
 
 		 543 aa  185  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  31.69 
 
 		 538 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 564 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.17 
 
 		 540 aa  183  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  28.18 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.41 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.25 
 
 		 543 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.79 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.68 
 
 		 579 aa  181  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.05 
 
 		 547 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.26 
 
 		 538 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.88 
 
 		 619 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.22 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.14 
 
 		 522 aa  173  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.96 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.07 
 
 		 562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  26.23 
 
 		 544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 552 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  28.22 
 
 		 581 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.87 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  26.68 
 
 		 555 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.78 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  26.09 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.06 
 
 		 522 aa  165  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.69 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  26.75 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.08 
 
 		 557 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.28 
 
 		 522 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  26.23 
 
 		 522 aa  164  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 557 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 522 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.33 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.33 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  27.67 
 
 		 574 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.27 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 543 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 537 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.37 
 
 		 520 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  25.39 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  27.71 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 536 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>