More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2366 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 553 aa  1118    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  46.11 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  46.12 
 
 		 556 aa  482  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  46.46 
 
 		 550 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  49.21 
 
 		 560 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  46.6 
 
 		 619 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  45.64 
 
 		 544 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  44.18 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  48.95 
 
 		 565 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  42.88 
 
 		 553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  44.4 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  45.23 
 
 		 543 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  43.12 
 
 		 540 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  45.74 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  45.77 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  42.54 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  44.97 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  42.27 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  41.32 
 
 		 563 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  46.03 
 
 		 536 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  45.01 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  42.09 
 
 		 556 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  46.14 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  39.92 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  39.34 
 
 		 579 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  41.59 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  37.11 
 
 		 556 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  44.95 
 
 		 565 aa  339  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  46.14 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  38.98 
 
 		 527 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  37.68 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  39.46 
 
 		 589 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  39.56 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  38.59 
 
 		 548 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  32.84 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  33.89 
 
 		 569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 522 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  33.14 
 
 		 522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  38.64 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  32.95 
 
 		 522 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  32.77 
 
 		 522 aa  283  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  32.95 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  32.01 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  32.77 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  32.77 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  32.51 
 
 		 522 aa  280  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.88 
 
 		 522 aa  277  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  37.13 
 
 		 537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  32.39 
 
 		 522 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  36.83 
 
 		 549 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  35.88 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  34.5 
 
 		 542 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  36.28 
 
 		 543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  35.87 
 
 		 548 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 542 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.43 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.78 
 
 		 574 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  36.04 
 
 		 538 aa  250  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 526 aa  249  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.03 
 
 		 545 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  32.03 
 
 		 555 aa  242  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  32.37 
 
 		 560 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 582 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  34.69 
 
 		 547 aa  241  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.48 
 
 		 584 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 596 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.7 
 
 		 537 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  31.17 
 
 		 585 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 		 537 aa  236  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  35.71 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  32.9 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  35.71 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  35.71 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  34.25 
 
 		 556 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  34.11 
 
 		 544 aa  230  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  32.09 
 
 		 565 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  31.95 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.94 
 
 		 542 aa  229  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  31.69 
 
 		 562 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.45 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  34.33 
 
 		 539 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  34.8 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 565 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  32.07 
 
 		 580 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.86 
 
 		 538 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  34.39 
 
 		 501 aa  220  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  32.86 
 
 		 550 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 573 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  31.28 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.73 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  32.51 
 
 		 550 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  30.66 
 
 		 583 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>