More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2836 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  63.59 
 
 		 576 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  100 
 
 		 597 aa  1237    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  39.09 
 
 		 624 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  35.09 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 		 638 aa  346  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 552 aa  203  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  27.52 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  27.52 
 
 		 555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  27.49 
 
 		 545 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  26.78 
 
 		 554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  29.96 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  27.77 
 
 		 542 aa  191  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.6 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3968  amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  26.68 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  26.55 
 
 		 557 aa  180  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 592 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.59 
 
 		 581 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.75 
 
 		 575 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.67 
 
 		 575 aa  163  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 		 563 aa  163  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  24.73 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  26.19 
 
 		 625 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  24.51 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  25.98 
 
 		 586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  25.22 
 
 		 541 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  24.87 
 
 		 584 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  25.62 
 
 		 545 aa  143  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  25.43 
 
 		 601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  25.53 
 
 		 603 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  25.34 
 
 		 542 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.96 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  24.48 
 
 		 620 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  23.57 
 
 		 583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.09 
 
 		 539 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  23.57 
 
 		 583 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  23.57 
 
 		 543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  24.25 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  24.49 
 
 		 590 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.04 
 
 		 604 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  24.82 
 
 		 540 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  24.64 
 
 		 580 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  25.46 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.85 
 
 		 527 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  24.23 
 
 		 564 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  23.81 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  23.36 
 
 		 560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  24.21 
 
 		 564 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.1 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  24.47 
 
 		 548 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  22.76 
 
 		 569 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.8 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  24.44 
 
 		 583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  25 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  24.61 
 
 		 585 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  24.52 
 
 		 618 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  24.08 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  24.32 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  23.34 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  28.08 
 
 		 525 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  22.4 
 
 		 576 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  25.51 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  23.7 
 
 		 648 aa  107  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  24.66 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 542 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  23.73 
 
 		 580 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.26 
 
 		 557 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  22.67 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  23.44 
 
 		 616 aa  104  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  23.77 
 
 		 580 aa  104  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  23.4 
 
 		 522 aa  103  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  23.92 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  25.22 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  22.88 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  23.13 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  25.36 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  22.88 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  23.68 
 
 		 568 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.58 
 
 		 552 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  24.78 
 
 		 569 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  22 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  22.01 
 
 		 560 aa  100  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  23.39 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  24.34 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  22.8 
 
 		 527 aa  98.2  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  22.62 
 
 		 526 aa  97.8  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  25.87 
 
 		 563 aa  97.4  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  21.93 
 
 		 543 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  23.22 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  22.16 
 
 		 563 aa  95.1  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  23.39 
 
 		 576 aa  95.5  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  20.76 
 
 		 542 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  21.72 
 
 		 543 aa  94.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>