More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1932 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  100 
 
 
522 aa  1090    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  31.8 
 
 
539 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.7 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.61 
 
 
546 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.93 
 
 
560 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.57 
 
 
545 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 
557 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  28.02 
 
 
558 aa  182  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.62 
 
 
541 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.91 
 
 
530 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.5 
 
 
549 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.06 
 
 
563 aa  176  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.15 
 
 
564 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.38 
 
 
543 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.73 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.16 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.02 
 
 
565 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.68 
 
 
522 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
556 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
546 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.54 
 
 
522 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.36 
 
 
522 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.54 
 
 
522 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  26.29 
 
 
568 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.73 
 
 
522 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  28.46 
 
 
543 aa  171  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.15 
 
 
522 aa  171  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  26.58 
 
 
475 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.36 
 
 
522 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.11 
 
 
583 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.78 
 
 
575 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.13 
 
 
522 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.78 
 
 
575 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.54 
 
 
522 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.99 
 
 
548 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 
527 aa  167  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.24 
 
 
557 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.99 
 
 
539 aa  166  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.59 
 
 
548 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  28.33 
 
 
522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.85 
 
 
556 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.42 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.04 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  27.65 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.95 
 
 
565 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.03 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  28.62 
 
 
592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 
549 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  27.45 
 
 
554 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  26.5 
 
 
551 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 
544 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.71 
 
 
538 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30 
 
 
537 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.86 
 
 
601 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.82 
 
 
583 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
540 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 
556 aa  160  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.09 
 
 
550 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.39 
 
 
562 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.6 
 
 
542 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 
505 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.55 
 
 
581 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.27 
 
 
574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 
553 aa  156  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.17 
 
 
522 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.44 
 
 
548 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.81 
 
 
543 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.42 
 
 
526 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.4 
 
 
564 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.02 
 
 
540 aa  153  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
537 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.55 
 
 
543 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  26.13 
 
 
568 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  26.31 
 
 
552 aa  150  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.56 
 
 
527 aa  150  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  26.76 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  26.06 
 
 
565 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 
477 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.21 
 
 
539 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 
539 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.32 
 
 
553 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.17 
 
 
537 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  26.28 
 
 
531 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  25.74 
 
 
564 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  27.85 
 
 
535 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.92 
 
 
648 aa  141  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  28.43 
 
 
525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  27.24 
 
 
564 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  26.43 
 
 
533 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.29 
 
 
541 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  29.74 
 
 
544 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  25.52 
 
 
583 aa  139  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  26.07 
 
 
585 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  25.71 
 
 
580 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.43 
 
 
541 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.37 
 
 
544 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  25.51 
 
 
536 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  25.51 
 
 
536 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  25.51 
 
 
536 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>