More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1574 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  100 
 
 
540 aa  1067    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  52.71 
 
 
562 aa  548  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  55.71 
 
 
539 aa  544  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  31.76 
 
 
452 aa  258  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 
520 aa  256  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  34.31 
 
 
583 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 
527 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  31.22 
 
 
533 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.27 
 
 
553 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.24 
 
 
539 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  32.15 
 
 
553 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 
532 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  30.87 
 
 
522 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.02 
 
 
556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.3 
 
 
522 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  31.11 
 
 
522 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.38 
 
 
522 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.48 
 
 
522 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.11 
 
 
522 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.11 
 
 
522 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  31.11 
 
 
522 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.68 
 
 
522 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.98 
 
 
522 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  33.57 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.64 
 
 
556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.56 
 
 
522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.53 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.78 
 
 
556 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  33.52 
 
 
538 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.66 
 
 
530 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.56 
 
 
543 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  28.07 
 
 
505 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  30.46 
 
 
539 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.9 
 
 
565 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.73 
 
 
546 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  34.75 
 
 
556 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  34.99 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 
537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.86 
 
 
542 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  35.17 
 
 
518 aa  200  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  30.36 
 
 
548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.94 
 
 
550 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 
544 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  30.63 
 
 
527 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  35.38 
 
 
548 aa  196  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.18 
 
 
619 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.83 
 
 
549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  32.85 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  31.05 
 
 
520 aa  190  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  30.1 
 
 
557 aa  189  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  32.21 
 
 
616 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.77 
 
 
526 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
552 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  33.07 
 
 
554 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  34.82 
 
 
513 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.83 
 
 
584 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.14 
 
 
560 aa  187  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  32.97 
 
 
539 aa  186  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.96 
 
 
537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.2 
 
 
548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 
536 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.85 
 
 
542 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.81 
 
 
535 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  34.68 
 
 
565 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.04 
 
 
537 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  34.64 
 
 
525 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.57 
 
 
543 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  32.15 
 
 
550 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.98 
 
 
568 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  32.55 
 
 
537 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.41 
 
 
541 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  32.15 
 
 
550 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.78 
 
 
544 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
553 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
530 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
530 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  33.27 
 
 
530 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  32.98 
 
 
547 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.78 
 
 
564 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  33.08 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.93 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.34 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.21 
 
 
540 aa  173  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.57 
 
 
564 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  31.1 
 
 
540 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  29.93 
 
 
547 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  32.56 
 
 
512 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  31.63 
 
 
553 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.46 
 
 
539 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 
557 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  33.92 
 
 
546 aa  170  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.89 
 
 
574 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.6 
 
 
546 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  32.04 
 
 
559 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  28.01 
 
 
581 aa  167  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  33.2 
 
 
548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.85 
 
 
555 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  32.03 
 
 
545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.19 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>