More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3397 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 518 aa  1007    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  65.98 
 
 		 552 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  59.09 
 
 		 530 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  59.09 
 
 		 530 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  59.09 
 
 		 530 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  57.79 
 
 		 526 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  53.43 
 
 		 541 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  56.47 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  58.13 
 
 		 526 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  54.73 
 
 		 520 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  53.47 
 
 		 553 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  52.38 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  53.31 
 
 		 546 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  48.97 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  48.78 
 
 		 521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  47.24 
 
 		 558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  46.99 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  47.7 
 
 		 542 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  51.98 
 
 		 547 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.48 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  49.03 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  45.39 
 
 		 563 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  43.47 
 
 		 559 aa  356  5.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  50.43 
 
 		 513 aa  339  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  39.27 
 
 		 541 aa  313  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.38 
 
 		 522 aa  282  9e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  30.27 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  35.03 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 553 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 583 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.88 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.09 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  31.67 
 
 		 540 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.66 
 
 		 568 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 562 aa  146  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 543 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.85 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.03 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.66 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.43 
 
 		 560 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.11 
 
 		 543 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.15 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.15 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  32.29 
 
 		 579 aa  140  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  34.05 
 
 		 565 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.3 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  26.41 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 550 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  32.75 
 
 		 554 aa  134  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.61 
 
 		 548 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.61 
 
 		 556 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.77 
 
 		 543 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.55 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.64 
 
 		 553 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  23.83 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 552 aa  128  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.58 
 
 		 543 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.98 
 
 		 556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.12 
 
 		 541 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.65 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 552 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.39 
 
 		 544 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 512 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  31.49 
 
 		 485 aa  123  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.1 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.25 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.19 
 
 		 545 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.15 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.7 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.74 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  23.51 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.68 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.68 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.08 
 
 		 536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  25.31 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.81 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.95 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.29 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  32.88 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.1 
 
 		 544 aa  114  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  31 
 
 		 536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.48 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.54 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.46 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.46 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.68 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.46 
 
 		 544 aa  110  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.41 
 
 		 536 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.22 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  23.51 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.05 
 
 		 555 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.81 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  26.87 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.39 
 
 		 538 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>