More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0160 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  79.68 
 
 		 520 aa  838    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 512 aa  1031    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 545 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  33.6 
 
 		 533 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  32.06 
 
 		 543 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  33.06 
 
 		 541 aa  220  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.3 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  31.87 
 
 		 543 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 539 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 583 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.92 
 
 		 546 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.78 
 
 		 549 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.72 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  31.91 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.85 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.68 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  35.31 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 520 aa  193  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  33.27 
 
 		 564 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.19 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.19 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.19 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.25 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.08 
 
 		 538 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.32 
 
 		 557 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.99 
 
 		 522 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.94 
 
 		 560 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.85 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.67 
 
 		 584 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.65 
 
 		 522 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.3 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 545 aa  187  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  34.29 
 
 		 548 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.9 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  30.21 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.81 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.73 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  30.47 
 
 		 564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.2 
 
 		 522 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.8 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.66 
 
 		 522 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.08 
 
 		 556 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.85 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.48 
 
 		 530 aa  180  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 548 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.84 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 562 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.38 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.25 
 
 		 526 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.52 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.22 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.96 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  31.47 
 
 		 576 aa  173  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.5 
 
 		 542 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  29.17 
 
 		 557 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  30.65 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.26 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 540 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 556 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 573 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.87 
 
 		 543 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.15 
 
 		 619 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 542 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  29.84 
 
 		 568 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 537 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.54 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.77 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.66 
 
 		 583 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  28.86 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  29.49 
 
 		 533 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.6 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 564 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.54 
 
 		 564 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 563 aa  156  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 535 aa  156  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  29.24 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.88 
 
 		 544 aa  153  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  31.37 
 
 		 544 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 555 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.47 
 
 		 543 aa  150  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  30.84 
 
 		 574 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  30.1 
 
 		 553 aa  147  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.74 
 
 		 536 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  28.88 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  32.3 
 
 		 475 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  29.75 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>