More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0480 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 544 aa  1133    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  52.22 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  51.33 
 
 		 543 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  45.64 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  39.66 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  39.42 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  38.5 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  37.17 
 
 		 552 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  37.02 
 
 		 548 aa  346  5e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  37.02 
 
 		 557 aa  344  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  37.45 
 
 		 560 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  35.58 
 
 		 556 aa  343  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  36.4 
 
 		 550 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  36.85 
 
 		 619 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  35.33 
 
 		 579 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.89 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  33.97 
 
 		 544 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.77 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.49 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  34.85 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  35.35 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  34.4 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.64 
 
 		 530 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  35.16 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.83 
 
 		 556 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.12 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  32.74 
 
 		 563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  32.02 
 
 		 527 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.83 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  32.32 
 
 		 589 aa  242  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  32.46 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.49 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  30.21 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  34.71 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.11 
 
 		 520 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 539 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.86 
 
 		 542 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.85 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 569 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.77 
 
 		 522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.77 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.77 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.77 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  27.58 
 
 		 522 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.65 
 
 		 574 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.29 
 
 		 541 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.58 
 
 		 522 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.26 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  27.58 
 
 		 522 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.83 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  27.12 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.39 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  27.58 
 
 		 522 aa  203  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 553 aa  203  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 537 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 540 aa  196  9e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.45 
 
 		 542 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 538 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.3 
 
 		 573 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.65 
 
 		 543 aa  190  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  28.45 
 
 		 564 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 557 aa  187  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.87 
 
 		 537 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  28.55 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 555 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.74 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.94 
 
 		 542 aa  177  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  27.43 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  25.76 
 
 		 620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  26.88 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.11 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.9 
 
 		 575 aa  174  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 583 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 583 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.16 
 
 		 596 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.96 
 
 		 576 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.55 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 606 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  28.57 
 
 		 485 aa  170  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 552 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  27.65 
 
 		 550 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  26.41 
 
 		 543 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 550 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.43 
 
 		 589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  26.4 
 
 		 601 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>