More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2586 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  100 
 
 		 537 aa  1059    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  79.21 
 
 		 549 aa  852    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 539 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  37.13 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  33.97 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  36.6 
 
 		 530 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  35.91 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  32.7 
 
 		 543 aa  247  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  32.54 
 
 		 541 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 583 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  33.08 
 
 		 527 aa  236  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.41 
 
 		 556 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.54 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.78 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  30.41 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  34.73 
 
 		 538 aa  231  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.22 
 
 		 522 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  30.22 
 
 		 522 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  30.04 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  30.04 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 522 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.98 
 
 		 522 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 543 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 533 aa  224  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  36.23 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.58 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 546 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.18 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.87 
 
 		 564 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.22 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  35.99 
 
 		 543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.59 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 556 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  38.07 
 
 		 536 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  30.06 
 
 		 557 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.05 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  33.7 
 
 		 539 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 548 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 539 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.88 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.83 
 
 		 544 aa  200  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  27.97 
 
 		 574 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  36.12 
 
 		 568 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 550 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  31.4 
 
 		 583 aa  196  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  32.13 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  35.89 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34.3 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 548 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.97 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.34 
 
 		 564 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 569 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  33.14 
 
 		 522 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.23 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 603 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.67 
 
 		 545 aa  187  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  38.27 
 
 		 536 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 619 aa  186  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 537 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.67 
 
 		 575 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.67 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  37.12 
 
 		 565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31.59 
 
 		 565 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.96 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 655 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  33.21 
 
 		 537 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  32.28 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  28.33 
 
 		 568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.52 
 
 		 616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.95 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  34.2 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  35.91 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  35.91 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  35.91 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 555 aa  176  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 538 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  36.35 
 
 		 532 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.94 
 
 		 540 aa  172  9e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 648 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.9 
 
 		 604 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 536 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  35.8 
 
 		 532 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  27.16 
 
 		 505 aa  170  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.08 
 
 		 537 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 		 543 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.71 
 
 		 541 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  30.33 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  34.2 
 
 		 535 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>