More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3024 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  59.48 
 
 		 557 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  67.27 
 
 		 548 aa  769    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  100 
 
 		 556 aa  1140    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  61.62 
 
 		 619 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  58.53 
 
 		 553 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  64.91 
 
 		 550 aa  751    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  51.18 
 
 		 565 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  49.62 
 
 		 546 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  46.7 
 
 		 552 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  46.72 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  46.12 
 
 		 553 aa  482  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  43.27 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  41.87 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  41.73 
 
 		 554 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  42.23 
 
 		 540 aa  358  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  44.63 
 
 		 536 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  35.58 
 
 		 544 aa  343  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  40.64 
 
 		 565 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  44.63 
 
 		 536 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  36.57 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  37.4 
 
 		 583 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  36.62 
 
 		 563 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  38.05 
 
 		 527 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  36.91 
 
 		 530 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  37.83 
 
 		 579 aa  313  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  41.65 
 
 		 532 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  38.96 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  40.08 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.19 
 
 		 556 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  44.21 
 
 		 532 aa  296  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.05 
 
 		 556 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 		 589 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  32.53 
 
 		 539 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.54 
 
 		 522 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 543 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  30.93 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  35.37 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.96 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 569 aa  253  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  29.38 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 522 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.24 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.95 
 
 		 522 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.56 
 
 		 542 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.18 
 
 		 522 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  28.99 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  28.99 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  29.35 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.35 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.14 
 
 		 542 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 535 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  30.57 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  31.77 
 
 		 573 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.74 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.63 
 
 		 537 aa  226  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31.26 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.17 
 
 		 547 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.52 
 
 		 544 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 537 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  30.78 
 
 		 540 aa  211  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.93 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  31.42 
 
 		 544 aa  208  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.31 
 
 		 539 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.26 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  31.31 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.71 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 545 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 565 aa  200  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  29.11 
 
 		 541 aa  200  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 501 aa  200  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  30.02 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.6 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.04 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 552 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 548 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 548 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 620 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  30.12 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  31.97 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 601 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 557 aa  194  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 527 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.17 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 562 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.06 
 
 		 575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.06 
 
 		 575 aa  191  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 569 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.67 
 
 		 564 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.91 
 
 		 596 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  32.3 
 
 		 477 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 543 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 582 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>