More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1844 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  100 
 
 		 554 aa  1108    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  60.04 
 
 		 568 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  65.91 
 
 		 565 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  46.68 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  45.29 
 
 		 546 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  41.67 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  43.63 
 
 		 565 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  43.24 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  41.08 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  41.64 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  40.61 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  41.14 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  45.21 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  40.37 
 
 		 557 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  41.12 
 
 		 543 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.56 
 
 		 540 aa  317  4e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  36.08 
 
 		 544 aa  293  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  38.06 
 
 		 532 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  37.19 
 
 		 530 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  42.24 
 
 		 536 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  38.22 
 
 		 579 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  38.33 
 
 		 556 aa  277  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  42.65 
 
 		 536 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  35.55 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  35.51 
 
 		 583 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  38.33 
 
 		 544 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 539 aa  260  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  44 
 
 		 532 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  43.51 
 
 		 532 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  37.23 
 
 		 522 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  32.45 
 
 		 563 aa  246  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  34.33 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  35.31 
 
 		 542 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  35.29 
 
 		 553 aa  233  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  31.21 
 
 		 533 aa  230  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.04 
 
 		 522 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.04 
 
 		 522 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.83 
 
 		 522 aa  228  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.04 
 
 		 522 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  30.63 
 
 		 522 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  35.67 
 
 		 549 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  33.48 
 
 		 589 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.61 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  29.85 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.42 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  33.33 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.35 
 
 		 522 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  35.89 
 
 		 537 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 569 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  29.58 
 
 		 522 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.79 
 
 		 522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  35.66 
 
 		 485 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  33.6 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.23 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.06 
 
 		 538 aa  203  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  29.64 
 
 		 574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  33.02 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  34.58 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  33.9 
 
 		 541 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 537 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.76 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  32.52 
 
 		 549 aa  194  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 548 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 548 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 548 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.95 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 526 aa  191  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.12 
 
 		 547 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  34.33 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.42 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  33.4 
 
 		 542 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  33.27 
 
 		 543 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27.86 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.46 
 
 		 548 aa  180  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 522 aa  179  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.11 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.79 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.93 
 
 		 562 aa  178  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  28.77 
 
 		 541 aa  176  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  34.92 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.06 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.37 
 
 		 539 aa  174  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  29.48 
 
 		 549 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  32.13 
 
 		 541 aa  170  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 520 aa  169  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.94 
 
 		 542 aa  169  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  29.84 
 
 		 573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25 
 
 		 539 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30.99 
 
 		 499 aa  160  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  31.23 
 
 		 573 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  25.05 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  30.78 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.39 
 
 		 537 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>