More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3957 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  58.04 
 
 		 557 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  100 
 
 		 553 aa  1135    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  58.53 
 
 		 556 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  57.01 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  55.2 
 
 		 619 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  54.12 
 
 		 550 aa  610  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  49.91 
 
 		 565 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  47.92 
 
 		 546 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  44.12 
 
 		 560 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  45.35 
 
 		 552 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  42.88 
 
 		 553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  42.71 
 
 		 543 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  39.42 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  41.65 
 
 		 554 aa  365  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  39.89 
 
 		 568 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  40.18 
 
 		 540 aa  359  7e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  40.82 
 
 		 565 aa  353  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  35.46 
 
 		 563 aa  329  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  40.04 
 
 		 536 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  37.63 
 
 		 527 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  38.43 
 
 		 579 aa  313  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  36.42 
 
 		 532 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  40.59 
 
 		 536 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  39.51 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  39.5 
 
 		 522 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  40.59 
 
 		 532 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  34.76 
 
 		 583 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 530 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  33.64 
 
 		 539 aa  289  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.67 
 
 		 556 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  40.66 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  35.27 
 
 		 589 aa  280  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  32.91 
 
 		 556 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  33.76 
 
 		 543 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.45 
 
 		 542 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  31.04 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.57 
 
 		 569 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  31.78 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  31.7 
 
 		 522 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.28 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 520 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  31.7 
 
 		 522 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.94 
 
 		 522 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  32.45 
 
 		 574 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.61 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  31.01 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.86 
 
 		 542 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.28 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.02 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  31.02 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.02 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.15 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.61 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.39 
 
 		 544 aa  224  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.16 
 
 		 539 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.23 
 
 		 549 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  31 
 
 		 537 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  30.12 
 
 		 547 aa  213  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.14 
 
 		 543 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.49 
 
 		 541 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30 
 
 		 620 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.7 
 
 		 573 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.86 
 
 		 526 aa  204  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.33 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.08 
 
 		 543 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.33 
 
 		 543 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  29 
 
 		 606 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 545 aa  200  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.08 
 
 		 541 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 573 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.15 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.67 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.42 
 
 		 552 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 543 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 583 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.7 
 
 		 583 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 565 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.91 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 557 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  28.51 
 
 		 616 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 544 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.04 
 
 		 562 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.3 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 601 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  28.24 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.03 
 
 		 550 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  27.61 
 
 		 563 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.88 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>