More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09320 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  59.16 
 
 
547 aa  656    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 
544 aa  1117    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  52.95 
 
 
542 aa  544  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  34.73 
 
 
527 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.43 
 
 
553 aa  257  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  32.57 
 
 
560 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.17 
 
 
522 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.83 
 
 
543 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.15 
 
 
542 aa  233  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.31 
 
 
532 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.51 
 
 
583 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.81 
 
 
556 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  31.39 
 
 
553 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  31.59 
 
 
557 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.78 
 
 
546 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.52 
 
 
556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.88 
 
 
619 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  31.17 
 
 
542 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.4 
 
 
553 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.2 
 
 
548 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  30.85 
 
 
573 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  31.55 
 
 
560 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.71 
 
 
530 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.44 
 
 
574 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.68 
 
 
556 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  32.14 
 
 
538 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  30.39 
 
 
544 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.58 
 
 
569 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.01 
 
 
550 aa  203  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.97 
 
 
537 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  31.34 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  34.69 
 
 
565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.25 
 
 
568 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  30.58 
 
 
543 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.65 
 
 
549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.83 
 
 
537 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.62 
 
 
564 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  30.73 
 
 
569 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.02 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.25 
 
 
535 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.39 
 
 
552 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.24 
 
 
616 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  30.44 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.29 
 
 
565 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  29.2 
 
 
583 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.05 
 
 
543 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  29.05 
 
 
603 aa  193  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.64 
 
 
522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.07 
 
 
522 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.39 
 
 
545 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  27.64 
 
 
526 aa  192  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  33.88 
 
 
550 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  33.88 
 
 
550 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.02 
 
 
522 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  31.27 
 
 
554 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.66 
 
 
522 aa  190  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  26.64 
 
 
522 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  26.64 
 
 
522 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
546 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  26.83 
 
 
522 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  30.28 
 
 
573 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  30.26 
 
 
579 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.89 
 
 
564 aa  187  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
549 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.8 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.38 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.27 
 
 
564 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.47 
 
 
539 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.6 
 
 
552 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 
584 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.76 
 
 
575 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.76 
 
 
575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.7 
 
 
520 aa  181  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  30.04 
 
 
541 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.92 
 
 
555 aa  181  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.74 
 
 
533 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.04 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.27 
 
 
536 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.59 
 
 
606 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.55 
 
 
596 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.78 
 
 
539 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  27.88 
 
 
613 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  28.49 
 
 
575 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.5 
 
 
538 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
583 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
583 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.78 
 
 
540 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  29.5 
 
 
543 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.8 
 
 
541 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.14 
 
 
537 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.99 
 
 
585 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.47 
 
 
576 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.66 
 
 
522 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  31.53 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  31.53 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  31.53 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  27.81 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.14 
 
 
608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.22 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.67 
 
 
540 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>