More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3836 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 550 aa  1086    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3821  hypothetical protein  82.13 
 
 		 406 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  98.55 
 
 		 550 aa  1073    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  48.36 
 
 		 555 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  38.62 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.39 
 
 		 574 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  32.76 
 
 		 542 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.86 
 
 		 553 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.3 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  31.75 
 
 		 569 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.21 
 
 		 556 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.22 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3819  hypothetical protein  77.33 
 
 		 160 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.19 
 
 		 527 aa  209  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.57 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 603 aa  207  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  31.9 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  34.4 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  30.26 
 
 		 576 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.88 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 619 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  30.24 
 
 		 560 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  34.77 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 548 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.03 
 
 		 553 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  36.23 
 
 		 564 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  33.28 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  33.04 
 
 		 574 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 616 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  30.11 
 
 		 620 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.67 
 
 		 596 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  29.06 
 
 		 541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.48 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 579 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  31.8 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.08 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.77 
 
 		 564 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.45 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 550 aa  180  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.87 
 
 		 546 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.72 
 
 		 585 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  27.46 
 
 		 568 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  32.16 
 
 		 537 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  30.76 
 
 		 564 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.57 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.88 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  28.25 
 
 		 606 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.02 
 
 		 522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 613 aa  174  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.33 
 
 		 557 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.83 
 
 		 544 aa  173  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 584 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.51 
 
 		 580 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.74 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 589 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.25 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 608 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.19 
 
 		 541 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.69 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  29.54 
 
 		 565 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  29.4 
 
 		 560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  30.99 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  29.51 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  31.55 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 544 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.34 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 568 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  29.4 
 
 		 580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.08 
 
 		 540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 601 aa  163  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 549 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  28.22 
 
 		 575 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.12 
 
 		 575 aa  160  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.84 
 
 		 563 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 573 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.64 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  27.11 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  29.08 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.94 
 
 		 575 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  29.52 
 
 		 544 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.27 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>