More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3819 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3819  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  316  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  77.85 
 
 		 550 aa  223  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  75.17 
 
 		 550 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  46.58 
 
 		 555 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  38.1 
 
 		 576 aa  90.5  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  36.57 
 
 		 549 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  36 
 
 		 542 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  35.97 
 
 		 622 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  35.81 
 
 		 542 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  34.72 
 
 		 541 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  36.43 
 
 		 621 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  35.07 
 
 		 546 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  34.87 
 
 		 580 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  37.84 
 
 		 560 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  51.25 
 
 		 543 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  51.25 
 
 		 560 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  36.3 
 
 		 539 aa  76.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  50.63 
 
 		 538 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  35.57 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  37.14 
 
 		 619 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  38.85 
 
 		 612 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  29.61 
 
 		 585 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  36.88 
 
 		 655 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  36.55 
 
 		 584 aa  75.1  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  36.88 
 
 		 575 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  53.33 
 
 		 537 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  35.94 
 
 		 545 aa  73.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.69 
 
 		 530 aa  73.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  39.13 
 
 		 660 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 527 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  37.97 
 
 		 564 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  39.13 
 
 		 660 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  36.69 
 
 		 629 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  41.09 
 
 		 535 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  36.36 
 
 		 650 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  32.45 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 552 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  38.41 
 
 		 660 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  38.74 
 
 		 618 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  38.41 
 
 		 660 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  38.67 
 
 		 536 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.54 
 
 		 556 aa  71.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  38.67 
 
 		 536 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  38.67 
 
 		 536 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  40.14 
 
 		 564 aa  70.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  35.97 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  35.21 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  47.89 
 
 		 630 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  47.89 
 
 		 630 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 629 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  46.48 
 
 		 630 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  46.48 
 
 		 630 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  49.3 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  37.41 
 
 		 656 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  44.58 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  37.86 
 
 		 537 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  32.47 
 
 		 580 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  45.24 
 
 		 629 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 629 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 629 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  36.81 
 
 		 556 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 629 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  38.93 
 
 		 537 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  47.95 
 
 		 658 aa  68.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32 
 
 		 553 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  32.47 
 
 		 558 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.37 
 
 		 544 aa  67.8  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  34.55 
 
 		 591 aa  67.8  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  49.3 
 
 		 660 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  37.41 
 
 		 612 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  37.06 
 
 		 548 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  33.81 
 
 		 631 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  30.18 
 
 		 582 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  28.86 
 
 		 574 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  40.43 
 
 		 537 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  35.37 
 
 		 603 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  40.48 
 
 		 625 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  44.05 
 
 		 630 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  45.24 
 
 		 625 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  35.46 
 
 		 656 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  32.32 
 
 		 562 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.86 
 
 		 540 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  34.27 
 
 		 547 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  35.46 
 
 		 533 aa  63.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  42.86 
 
 		 595 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  40.48 
 
 		 626 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  34.25 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  35.46 
 
 		 612 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  30.67 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  31.79 
 
 		 604 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  31.69 
 
 		 544 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  33.78 
 
 		 606 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  32.14 
 
 		 632 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  41.67 
 
 		 625 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  36.17 
 
 		 659 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  44.12 
 
 		 535 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>