More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42330 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  83.03 
 
 
660 aa  1135    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  66.34 
 
 
603 aa  793    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  80.45 
 
 
660 aa  1123    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  82.19 
 
 
612 aa  1046    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  65.22 
 
 
630 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  61.35 
 
 
611 aa  785    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  66.35 
 
 
632 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  67.37 
 
 
626 aa  826    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  66.56 
 
 
631 aa  910    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  61.35 
 
 
613 aa  786    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  66.61 
 
 
622 aa  863    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  80.3 
 
 
660 aa  1119    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  66.35 
 
 
632 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  62.65 
 
 
656 aa  793    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  83.01 
 
 
612 aa  1085    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  64.86 
 
 
632 aa  824    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  66.34 
 
 
658 aa  838    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  64.84 
 
 
629 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  80.61 
 
 
660 aa  1122    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  63.48 
 
 
660 aa  859    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  64.94 
 
 
625 aa  814    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  64.35 
 
 
629 aa  808    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  64.46 
 
 
625 aa  820    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  60.1 
 
 
626 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  65.79 
 
 
602 aa  814    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  65.23 
 
 
634 aa  831    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  65.81 
 
 
626 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  65.32 
 
 
630 aa  822    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  64.09 
 
 
629 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  67.79 
 
 
621 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  62.86 
 
 
655 aa  804    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  100 
 
 
656 aa  1348    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  64.52 
 
 
629 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  64.19 
 
 
629 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  66.35 
 
 
632 aa  832    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  85.13 
 
 
659 aa  1164    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  66.72 
 
 
626 aa  830    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  65.22 
 
 
630 aa  824    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  61.19 
 
 
611 aa  780    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  64.9 
 
 
630 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  65.22 
 
 
630 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  60.29 
 
 
643 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  86.93 
 
 
612 aa  1119    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  66.03 
 
 
625 aa  844    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  64.17 
 
 
629 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  64.52 
 
 
629 aa  808    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  64.19 
 
 
629 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  61.35 
 
 
611 aa  783    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  64.68 
 
 
626 aa  820    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  65.53 
 
 
619 aa  839    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  61.35 
 
 
611 aa  785    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  80.15 
 
 
660 aa  1117    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  64 
 
 
630 aa  816    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  65.53 
 
 
626 aa  832    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  66.18 
 
 
629 aa  808    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  61 
 
 
487 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.09 
 
 
595 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  53.01 
 
 
591 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  54.64 
 
 
593 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  57.43 
 
 
629 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  57.81 
 
 
661 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  57.81 
 
 
661 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  48.11 
 
 
618 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  50.09 
 
 
546 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  39.89 
 
 
557 aa  349  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  35.05 
 
 
566 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  34.86 
 
 
566 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  34.86 
 
 
566 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  34.68 
 
 
566 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  34.68 
 
 
566 aa  294  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.4 
 
 
546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.22 
 
 
549 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.33 
 
 
557 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.42 
 
 
545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.32 
 
 
556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.34 
 
 
539 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.92 
 
 
564 aa  174  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  29.53 
 
 
584 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.36 
 
 
537 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.29 
 
 
579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.21 
 
 
543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.75 
 
 
569 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
532 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  26.9 
 
 
530 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.01 
 
 
583 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.97 
 
 
549 aa  158  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.55 
 
 
553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.32 
 
 
564 aa  157  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.92 
 
 
541 aa  157  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25 
 
 
520 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.87 
 
 
544 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 
536 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  27.52 
 
 
601 aa  152  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.85 
 
 
527 aa  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4333  putative metallo-dependent hydrolase  28.94 
 
 
557 aa  151  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189362  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.34 
 
 
583 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  28.05 
 
 
556 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
543 aa  150  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.01 
 
 
527 aa  150  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.84 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>